chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	C1orf170,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr1	1008722	1008886	1008828	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	15608	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	TNFRSF4,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF4	3320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,VWA1	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	7.32943955018782
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	2772559	2772713	2772636	Y	HES5	NA	PRDM16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM213B	256629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1L	118501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	3421438	3421558	3421506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1L	118008	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	3634737	3634863	3634787	Y	WRAP73,TP73	NA	NA	NA	NA	NA	WRAP73	67412	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	73049	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	9111078	9111104	9111091	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	GPR157	76125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	9960528	9960713	9960585	Y	NA	CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1	NA	NA	NA	NA	CTNNBIP1	7681	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	10127211	10127315	10127266	Y	KIF1B	UBE4B	NA	NA	NA	NA	UBE4B	36321	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	11040299	11040592	11040356	Y	NA	TARDBP	NA	NA	NA	NA	TARDBP	29822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	11415566	11415939	11415808	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	84303	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	12493313	12493712	12493478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	205189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	221230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	12579035	12579403	12579221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	290911	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	13825180	13825414	13825304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	199279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	15585949	15586132	15586039	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	14181	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4493	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	17353741	17353845	17353793	Y	NA	MFAP2,ATP13A2,SDHB	ATP13A2	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	17318	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	19276270	19276542	19276361	Y	AKR7A2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	4638	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	19703880	19704261	19704067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	67060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	21406931	21406946	21406939	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	8685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	22692086	22692330	22692263	Y	NA	NA	C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	84014	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	23448967	23449247	23449107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	53054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	NA	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.4	75467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	25281668	25281921	25281754	Y	NA	RUNX3	NA	NA	NA	NA	RUNX3	7691	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	25348659	25349200	25348944	Y	SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	59047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	26123435	26123824	26123740	Y	NA	SEPN1	NA	NA	NA	NA	SEPN1	843	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	26337765	26338024	26337895	Y	PAQR7,ZNF683	PAFAH2,EXTL1	PAQR7,STMN1,EXTL1	IMR90	Hi-C	24141950	EXTL1	6351	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	28495580	28496044	28495868	Y	STX12,C1orf38,EYA3,SESN2,MED18,GMEB1,PTAFR,PTAFR,DNAJC8	AL353354.1	NA	NA	NA	NA	AL353354.1	29108	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	31320336	31320627	31320524	Y	NA	RP1-65J11.1	SDC3	K562	ChIA-PET	22265404	RP1-65J11.1	25261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B,HDAC1	NA	NA	NA	NA	FAM167B	21737	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	33804092	33804324	33804199	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	36592352	36592554	36592389	Y	NA	ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	TRAPPC3	20544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	36853020	36853462	36853143	Y	NA	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	3523	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	136331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	42351041	42351345	42351193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	148251	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A1	111279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	45860300	45860382	45860343	Y	IPP,TESK2,TOE1	NA	NA	NA	NA	NA	MUTYH	56158	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	64985	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	55828418	55828527	55828473	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2,C1orf168	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	149632	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	58898385	58898660	58898607	Y	NA	NA	DAB1,CYP2J2,OMA1,FGGY	IMR90	Hi-C	24141950	DAB1	111746	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	59629518	59629774	59629646	Y	NA	NA	LOC100131060,FGGY	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	130536	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	60144543	60144796	60144669	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	133662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	61333622	61333797	61333765	Y	NA	NFIA	INADL	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	4691	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	61369297	61369400	61369351	Y	NA	NFIA	NA	NA	NA	NA	NFIA	40366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-668G5.1	109163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	64558632	64559006	64558819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	251276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	66770897	66771283	66771085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	514700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	359133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	358223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	68364057	68364377	68364218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	66907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	68849988	68850367	68850179	Y	NA	NA	LOC100289178,WLS,RPE65	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	110537	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	71480052	71480316	71480184	Y	NA	PTGER3	NA	NA	NA	NA	PTGER3	31175	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	72493439	72493635	72493537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEGR1	252782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	76541670	76541922	76541777	Y	ST6GALNAC3	ST6GALNAC3	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	3266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	76776213	76776609	76776411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	237809	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	78469106	78469287	78469191	Y	DNAJB4	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	26247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	82103600	82103612	82103605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN2	333755	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84083536	84083914	84083802	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	240792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84289121	84289390	84289361	Y	SAMD13,SAMD13	RP11-475O6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	35316	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	DNASE2B	104601	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84872292	84872455	84872374	Y	NA	DNASE2B	NA	NA	NA	NA	DNASE2B	10077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.78518702907137
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	87240012	87240427	87240202	Y	SH3GLB1	NA	HS2ST1,SEP15,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	71753	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	87744782	87745159	87745088	Y	NA	LMO4	LOC339524	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	46992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	89112806	89113177	89112978	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	34728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	90077145	90077551	90077320	Y	ZNF326,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	19080	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	92086791	92087194	92086992	Y	NA	NA	TGFBR3,HSP90B3P,CDC7	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	122383	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	241118	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR760	182362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	65079	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	133941	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SNX7	336008	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	98868515	98868612	98868566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX7	256624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	100000188	100000393	100000274	Y	NA	NA	LPPR5	IMR90	Hi-C	24141950	PALMD	109106	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	101757305	101757513	101757430	Y	NA	NA	SLC30A7,DPH5	IMR90	Hi-C	24141950	DPH5	267661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1	NA	NA	NA	NA	PSRC1	17996	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	109938897	109939079	109938975	Y	TMEM167B,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	113525578	113525919	113525789	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC16A1	27943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	113683682	113683919	113683753	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	25697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	115627657	115627928	115627729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	306351	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	116370977	116371565	116371162	Y	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	145554	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	116918317	116918655	116918398	Y	NA	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	117017908	117018073	117017956	Y	ATP1A1	NA	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1OS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP1A1OS	58664	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	117030831	117031034	117030889	Y	ATP1A1,ATP1A1	NA	ATP1A1,ATP1A1OS,SLC22A15,MAB21L3,CD58	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP1A1OS	71587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	117032033	117032296	117032175	Y	ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	ATP1A1,SLC22A15,MAB21L3,ATP1A1OS,CD58	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP1A1OS	72789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	117040346	117040781	117040440	Y	ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	70880	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	118792385	118792801	118792430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG17	66539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	120178530	120178767	120178634	Y	NA	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	9629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	144009977	144010738	144010098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF8	134070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	80942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	145032376	145032564	145032466	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	41622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-120P	91522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	NA	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	PFN1P12	110116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H3A	534	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4	NA	NA	NA	NA	SF3B4	12664	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	149978692	149979077	149978971	Y	SV2A,CA14,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1548	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P,CA14	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	150231710	150231944	150231778	Y	ECM1,CA14	ANP32E,RNU2-17P,CA14,APH1A,C1orf51,MRPS21	NA	NA	NA	NA	CA14	4156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	153504746	153504953	153504860	Y	PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1	S100A6,S100A3,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	1767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154404273	154404562	154404390	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	28604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155484519	155484611	155484545	Y	KRTCAP2,GBA,SCAMP3,CLK2,RUSC1,RUSC1,RUSC1-AS1,RUSC1	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	45210	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156541089	156541488	156541192	Y	NA	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4	MEF2D,C1orf61	IMR90	Hi-C	24141950	IQGAP3	693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156631732	156631960	156631846	Y	NA	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2516	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	156632199	156632473	156632320	Y	NA	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2983	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	156645551	156645913	156645806	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	NES	362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	157966753	157967127	157966789	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	5690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	158075201	158075434	158075415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	114138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	158970513	158970716	158970581	Y	AIM2,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	2755	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	158982200	158982857	158982480	Y	AIM2,PYHIN1,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	14442	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	158983439	158983572	158983497	Y	NA	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	15681	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	160402251	160402521	160402355	Y	SLAMF7,SLAMF6,SLAMF1,LY9,CD48,CD244,SLAMF9	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	33875	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	10720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	SLAMF7	NA	NA	NA	NA	SLAMF7	30441	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	160807359	160807588	160807459	Y	SLAMF6,CD48,USF1,CD244,ARHGAP30,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	55182	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	161469487	161469783	161469607	Y	HSPA6,ATF6,FCER1G,FCGR2A	NA	FCGR2A	K562	ChIA-PET	22265404	SDHC	187440	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	161502624	161502920	161502837	Y	ADAMTS4,PCP4L1,C1orf192,OLFML2B	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLA	171842	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	161700146	161700332	161700210	Y	NA	FCRLA,DUSP12,ATF6	NA	NA	NA	NA	DUSP12	17216	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	60637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	166895888	166895941	166895915	Y	ILDR2	ILDR2	NA	NA	NA	NA	ILDR2	46778	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	172499206	172499418	172499304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	87976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	172750590	172750943	172750749	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,SLC9A11,KLHL20,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	339360	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	176024233	176024593	176024503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	135122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	178575191	178575363	178575289	Y	TOR3A,RALGPS2	NA	RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B,C1orf220	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf220	65304	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181046810	181047186	181046999	Y	NA	MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	8452	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181056649	181057124	181056887	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	1011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	182228341	182228499	182228429	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130842	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	182248717	182248735	182248728	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	110606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	182259351	182259676	182259514	Y	NA	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	99665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	183839940	183840077	183840009	Y	NCF2,NCF2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	178734	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	183855028	183855346	183855094	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	163465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184421485	184421696	184421591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	67293	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184475712	184475981	184475798	Y	EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	121520	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184828541	184828899	184828707	Y	IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	106494	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	184836042	184836526	184836376	Y	EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	105156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	185308384	185308771	185308525	Y	FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	23923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	185315008	185315352	185315218	Y	RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	SWT1	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	30547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	185408687	185409225	185409010	Y	NA	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	124226	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	185830907	185831026	185830956	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	129224	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	186052629	186052877	186052681	Y	HMCN1,PDC	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	289948	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	186818504	186818763	186818666	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	22419	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	186947742	186948198	186947923	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	151657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	186970666	186971051	186970863	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	174581	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	192783033	192783090	192783086	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	6864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	192914637	192914772	192914747	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	111780	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	110765	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	B3GALT2	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	26920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX9	85857	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	503631	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	449335	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	201739210	201739573	201739298	Y	CSRP1,CSRP1,CSRP1,NAV1,NAV1,SHISA4	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	56696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	204434923	204435081	204435020	Y	SOX13,PPP1R15B,PIK3C2B	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	26771	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	205216742	205217034	205216850	Y	MFSD4,NFASC,NFASC,CNTN2,CDK18,DSTYK,TMCC2	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	TMCC2	21438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	205228000	205228129	205228064	Y	TMEM81,DSTYK,TMCC2	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	TMCC2	32696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	206640538	206640724	206640631	Y	NA	IKBKE	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1067	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	206748515	206748888	206748591	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	35016	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr1	207064869	207064994	207064935	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	IL24	3794	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	207080273	207080661	207080467	Y	FAIM3,FAIM3,IL19	IL24,RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	1309	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	208081540	208081662	208081583	Y	CD34	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	158138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	208115711	208115874	208115793	Y	PLXNA2	NA	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	192309	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD46	213510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	208314292	208314663	208314422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	390890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	NA	CD46	495229	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	209556903	209557123	209556922	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	43042	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	SYT14	52099	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	211765642	211765767	211765693	Y	NA	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	15558	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	56451	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	212643548	212643711	212643612	Y	NA	NENF	ATF3	K562	ChIA-PET	22265404	NENF	39319	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	213500745	213500914	213500832	Y	RPS6KC1	NA	PROX1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KC1	278156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	218338759	218338973	218338866	Y	NA	NA	ESRRG	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	117656	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	67096	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	219971715	219971862	219971811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	246138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	221247820	221248047	221247891	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC2	328253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	221913881	221914483	221914426	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	363	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	222000173	222000483	222000346	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	86655	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	222135050	222135329	222135215	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	221532	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	222161205	222161607	222161394	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	247687	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	5.42378526713899
chr1	224730441	224730985	224730669	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	107706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	224924541	224924939	224924681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	157025	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226815517	226815910	226815821	Y	NA	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	44858	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226842752	226843521	226843149	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	17247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226867580	226868182	226867972	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	6812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	226997737	226998213	226997994	Y	C1orf95,ITPKB	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90	Hi-C	24141950	PSEN2	57672	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	231002258	231002436	231002323	Y	C1orf198,C1orf198,C1orf198	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	231531271	231531676	231531476	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	27114	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	231630305	231630490	231630353	Y	TSNAX	RP11-295G20.2,TSNAX	NA	NA	NA	NA	RP11-295G20.2	31812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	6.7430843861728
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr1	234754264	234754665	234754337	Y	NA	IRF2BP2	ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	10993	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	234891292	234891478	234891345	Y	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	148021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	235835688	235836968	235835896	Y	NA	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	23634	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	38803	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	235927486	235927702	235927520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG4	115432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr1	235994307	235994722	235994588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	50218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	236026265	236026446	236026400	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	18494	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	236027883	236028291	236028094	Y	NA	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	16649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236030835	236031025	236030880	Y	NA	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	13915	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	236041479	236041632	236041556	Y	NA	LYST	LYST,GNG4,B3GALNT2,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	3308	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr1	236082498	236082788	236082539	Y	LYST,GPR137B,EDARADD	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	37558	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	236323296	236323699	236323519	Y	LYST,GPR137B,LGALS8	GPR137B	NA	NA	NA	NA	GPR137B	19464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236856658	236857048	236856853	Y	ACTN2	ACTN2	NA	NA	NA	NA	ACTN2	8904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	236866415	236866949	236866639	Y	NA	ACTN2	NA	NA	NA	NA	ACTN2	18661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	238811242	238811567	238811347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRM3	736298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	239524689	239525075	239524869	Y	NA	CHRM3	NA	NA	NA	NA	CHRM3	22790	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	240397761	240398076	240397984	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	66306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	5.13060768513148
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	241804319	241804678	241804577	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	7087	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243637125	243637295	243637255	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	219805	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243853401	243853550	243853530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	158831	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243894639	243895081	243894755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	117300	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr1	245196282	245196669	245196476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	65275	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	245563795	245563810	245563803	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	247508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	246147829	246148201	246147973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	520413	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	246436053	246436378	246436216	Y	SMYD3,SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	232236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	246732690	246733040	246732711	Y	SMYD3,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	4944	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr1	246751015	246751281	246751184	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	23269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	246772310	246772610	246772421	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	44564	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	12.8998136083306
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	699938	700531	700398	Y	DIP2C	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	33152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	3239590	3239795	3239693	Y	NA	PITRM1	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	26587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	4173688	4174411	4173937	Y	KLF6	NA	KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00702	109693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	227013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	7041544	7041785	7041641	Y	NA	NA	SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	KIN	786205	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	7300945	7301168	7301056	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	526822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	10621382	10621742	10621475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	423517	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	11220579	11221039	11220795	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	175320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	135463	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	11980539	11980883	11980844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	102286	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	11983561	11983569	11983563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	99600	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	13812005	13812243	13812123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	185078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	14003091	14003406	14003339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	110877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	14015733	14016130	14015958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	98153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	14029325	14029736	14029659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	84547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	14057086	14057314	14057246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	56969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	14064122	14064423	14064398	Y	NA	RP11-397C18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	49860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	14066158	14066580	14066511	Y	NA	RP11-397C18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	47703	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	17028207	17028677	17028581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	170680	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	17248953	17248971	17248962	Y	TRDMT1,VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	TRDMT1,CUBN,VIM	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TRDMT1	6900	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	434343	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	21683965	21683997	21683982	Y	C10orf140	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	137097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	22919359	22919855	22919730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	81629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29196228	29196432	29196257	Y	BAMBI	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	231957	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29543500	29543829	29543664	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	152502	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29845158	29845363	29845275	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	148827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29877671	29877896	29877784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	145814	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29879091	29879350	29879257	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	144360	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29887787	29888175	29887987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	135535	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	29907407	29907668	29907538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	116042	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	38418230	38418599	38418292	Y	NA	ZNF37A	NA	NA	NA	NA	ZNF37A	36966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	45439361	45439737	45439549	Y	NA	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	13118	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	45469010	45469359	45469182	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	2899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	45731417	45731707	45731606	Y	C10orf10	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf25	237081	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	45914844	45915133	45915015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH8	173221	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	810961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	51574472	51574922	51574693	Y	FAM21A,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2,NCOA4	NA	NA	NA	NA	NCOA4	11364	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	52374532	52374543	52374538	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	8380	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	59452175	59452288	59452232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	573406	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63776644	63776930	63776794	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	117585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	119801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63803306	63803648	63803427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	144247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63805040	63805237	63805084	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	145981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63806320	63806697	63806416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	147261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63807017	63807353	63807186	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	147958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	64300187	64300318	64300222	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	168236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	64470060	64470410	64470121	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	ADO	92106	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	64875678	64875783	64875732	Y	NA	NRBF2	ZNF365,ADO,NRBF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRBF2	15267	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	68690818	68690961	68690956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA3	762966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	68755189	68755293	68755241	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA3	698634	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACR2	65190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	72258760	72259157	72258997	Y	KIAA1274	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	96625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	73649387	73649415	73649393	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	40261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	74019515	74019657	74019544	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	12021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.93177582007513
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	74836640	74837022	74836864	Y	NA	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	17710	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	81158970	81159167	81159085	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	44216	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	81191596	81191949	81191846	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	11434	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	82211651	82212098	82211867	Y	SH2D4B	FAM213A	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	82257950	82258092	82258025	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	35606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	82259709	82259999	82259959	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	33699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	82260440	82261008	82260524	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	32690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	83813687	83814033	83813708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	180617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	84158355	84158705	84158530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	525285	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	84649662	84649982	84649782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	1016592	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	90657069	90657527	90657362	Y	NA	STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	19578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	90745683	90745943	90745816	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	2471	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	90759367	90759687	90759559	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	10953	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	92783161	92783490	92783369	Y	NA	NA	PCGF5,ANKRD1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	104128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.19883186505635
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	93318603	93318995	93318800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	71816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	93320562	93320757	93320661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	70054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr10	94001133	94001473	94001377	Y	CPEB3,CPEB3	MARCH5	NA	NA	NA	NA	MARCH5	47447	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6P1	135436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	97166659	97166942	97166773	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	117878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	97308667	97309047	97308880	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	10124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	97809290	97809583	97809571	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	8139	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	101754114	101754425	101754203	Y	ENTPD7,ERLIN1,ERLIN1,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	13251	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	102792815	102793017	102792917	Y	NA	C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	SFXN3	3824	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	108349452	108349469	108349463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS1	572823	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	112010766	112010816	112010791	Y	NA	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	45403	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	NA	NA	NA	NA	NA	SMC3	75672	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	114025637	114025952	114025790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	52502	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	119021882	119022152	119021944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	110826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	121173391	121173574	121173483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	126646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	121277481	121277683	121277593	Y	EIF3A,RGS10	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	22537	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	121452837	121453189	121453108	Y	NA	BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	43955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	123914446	123914761	123914722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167757	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	124222687	124222865	124222833	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	3646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	CPXM2	NA	NA	NA	NA	CPXM2	32447	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	125974313	125974551	125974472	Y	CHST15	NA	CPXM2,CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	130994	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	126021099	126021412	126021201	Y	CHST15	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	84133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	114909	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr10	126360075	126360476	126360334	Y	LHPP,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	70362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	126397729	126397974	126397834	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	32864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	126406559	126407126	126406852	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	23712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.3715421930864
chr10	126413244	126413567	126413371	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	17271	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	126421726	126422139	126421939	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	8699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	127472572	127472831	127472732	Y	NA	UROS,BCCIP	NA	NA	NA	NA	UROS	36986	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	127714877	127714997	127714888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	131769	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	127905122	127905197	127905160	Y	ADAM12,MMP21	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	322014	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	127919956	127919968	127919963	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	336848	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	128351863	128352142	128352116	Y	NA	C10orf90	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf90	4937	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr10	128357201	128357366	128357267	Y	NA	C10orf90	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf90	122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	26035	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr10	135048867	135049308	135048949	Y	TUBGCP2,ADAM8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF511	70671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	46851	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	1536608	1536918	1536802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP8	54232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	1847921	1848122	1848046	Y	KRTAP5-3	NA	H19	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTSD	64699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	2961841	2962060	2961969	Y	KCNQ1	SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	13156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	3021368	3021548	3021402	Y	NA	NAP1L4	NAP1L4	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4	9761	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	3190411	3190716	3190538	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4442	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	5504793	5505065	5505006	Y	NA	HBE1	NA	NA	NA	NA	HBE1	19782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	8756335	8756571	8756455	Y	ST5,ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	54377	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	9907928	9908258	9908093	Y	NA	NA	SWAP70,LOC440028,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	224304	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	279551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	16073747	16074032	16073896	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	558647	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	17230717	17231092	17230803	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	NUCB2	3017	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	19599589	19599793	19599635	Y	NAV2,NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	229318	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	19717488	19717496	19717492	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	347217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	19748565	19748818	19748690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	378294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr11	19973702	19973983	19973824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	409248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	21478993	21479254	21479124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELL1	789876	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	23079827	23079841	23079834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	229982	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	31838721	31838861	31838791	Y	NA	RCN1	NA	NA	NA	NA	RCN1	6782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	33012698	33013071	33012885	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	DEPDC7	22339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	34393112	34393337	34393189	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	ABTB2,ELF5,NAT10,CAT	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	15557	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163403	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	PDHX	228200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	35088540	35088910	35088827	Y	NA	NA	CD44,PDHX,APIP	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	68669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	35187357	35188072	35187739	Y	NA	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	35358493	35359078	35358891	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	200076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	35704518	35704742	35704630	Y	NA	TRIM44	NA	NA	NA	NA	TRIM44	22165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	35966511	35966551	35966528	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	2980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	37497688	37497965	37497690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	883637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-430H10.1	172317	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-702F3.3	73228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr11	48102794	48103200	48102989	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	102681	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	57200214	57200547	57200409	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	SLC43A3,RTN4RL2	SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC43A3	7161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF,CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr11	59894907	59895094	59895001	Y	OR10V1,STX3,MS4A13,MS4A2	NA	NA	NA	NA	NA	MS4A7	248861	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	BEST1,FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	61871485	61871738	61871663	Y	NA	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	17707	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	61872496	61872975	61872791	Y	DAGLA,FTH1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	16470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	62226637	62226898	62226739	Y	FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	84573	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	63350815	63351029	63350927	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	31326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	64455963	64456049	64456006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	88209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	SNX32,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	SNX32	17144	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	65582060	65582341	65582183	Y	NA	SNX32,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	SNX32	16771	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65583188	65583268	65583228	Y	NA	SNX32,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	SNX32	15844	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr11	67105994	67106296	67106145	Y	NA	SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	16147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	67143202	67143472	67143423	Y	CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	4147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	7929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYEOV	123352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	195423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	70413927	70414164	70414002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	171333	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	2740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	72431268	72431435	72431330	Y	FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	71209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	74667774	74667939	74667906	Y	RNF169	XRRA1,SPCS2,NEU3	NA	NA	NA	NA	SPCS2	9482	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	74742390	74742651	74742474	Y	ARRB1	NEU3	XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	45211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	75748582	75748924	75748753	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	224370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	78298750	78298870	78298801	Y	NA	NARS2	NA	NA	NA	NA	NARS2	14831	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	78376949	78377109	78377029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	93030	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	86792626	86792948	86792684	Y	NA	TMEM135	NA	NA	NA	NA	TMEM135	45740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	87871692	87871803	87871780	Y	NA	RAB38	NA	NA	NA	NA	RAB38	34832	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	88901695	88901901	88901798	Y	TYR	TYR	NA	NA	NA	NA	TYR	6719	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	88909137	88909241	88909198	Y	TYR	TYR	NA	NA	NA	NA	TYR	517	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr11	89107962	89108343	89108309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYR	199342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	89219339	89219644	89219576	Y	NOX4	NA	NA	NA	NA	NA	FOLH1B	150039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	92767972	92767992	92767983	Y	NA	NA	SLC36A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	161138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	RP11-712B9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-712B9.2	1085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr11	94987550	94987767	94987639	Y	NA	SESN3	NA	NA	NA	NA	SESN3	23845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95745158	95745721	95745455	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	88679	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95838694	95838939	95838802	Y	FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	182215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	102631066	102631384	102631342	Y	BIRC2	MMP8,MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP8	35285	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16	144942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	105579191	105579256	105579211	Y	KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA4	100470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	108417188	108417527	108417358	Y	NA	EXPH5	NA	NA	NA	NA	EXPH5	44938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	109545709	109546087	109545903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	416000	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	109899806	109900193	109900029	Y	NA	NA	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	61894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	109939977	109940512	109940366	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	K562	ChIA-PET	22265404	ZC3H12C	21575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	109955970	109956386	109956351	Y	ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZC3H12C	5701	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	109957593	109958086	109957862	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZC3H12C	4001	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr11	109958650	109959379	109958908	Y	NA	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	2708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	52.9185535523561
chr11	109966397	109966711	109966537	Y	NA	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	4310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	110002516	110002895	110002708	Y	RDX	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	40429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	110220556	110220727	110220626	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	RP11-347E10.1	C11orf53,RDX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-347E10.1	3128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	112028082	112028533	112028265	Y	IL18	BCO2	NA	NA	NA	NA	BCO2	15657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	112655698	112656077	112655902	Y	NA	NA	NCAM1	IMR90	Hi-C	24141950	NCAM1	173920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	113053106	113053348	113053234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	129811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	115172228	115172553	115172441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	201122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	115360673	115361056	115361024	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	12619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	115373347	115373590	115373469	Y	NA	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	85	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	115801811	115802176	115802022	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00900	172466	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	121593077	121593718	121593342	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	272165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	121594118	121594399	121594120	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	273206	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2	NA	NA	NA	NA	MIRLET7A2	33917	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	125037243	125037532	125037366	Y	NA	PKNOX2	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	4660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	125146411	125146772	125146529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	113828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	126571241	126571490	126571472	Y	ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	347706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr11	128169091	128169261	128169176	Y	NA	NA	ETS1,FLI1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	286192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	128382635	128382833	128382761	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	72620	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	128422991	128423282	128423121	Y	ETS1	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	32171	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	128557379	128557710	128557562	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	2949	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	131630069	131630486	131630160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	845665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	131902527	131902770	131902649	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1118123	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	131934936	131935322	131935091	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1150532	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr11	132411283	132411428	132411357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAM3	1525392	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	293074	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	1699844	1700200	1699934	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	1131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	1925056	1925234	1925157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	59879	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6248004	6248757	6248208	Y	NA	NA	VWF,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	58124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	6288535	6288780	6288632	Y	CD9,VWF	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	18101	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6536099	6536375	6536311	Y	ZNF384,VAMP1,TAPBPL,LRRC23,LPAR5,IFFO1,CD4,CD4,CD27	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	9289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2	NA	NA	NA	NA	IFFO1	9	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	6713710	6714101	6713905	Y	PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4	NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	CHD4	541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7127	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	9055464	9055643	9055504	Y	CLEC6A,CLEC4D,CLEC4E,M6PR	M6PR	NA	NA	NA	NA	M6PR	44908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr12	9263143	9263504	9263324	Y	KLRB1,KLRG1	A2M	NA	NA	NA	NA	A2M	3321	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	9499401	9499742	9499599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	99083	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	10116971	10117241	10117106	Y	OLR1,CLEC12A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	96236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	11872628	11873141	11872822	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	71840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	11963262	11963646	11963299	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	162474	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	12162075	12162513	12162342	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	99584	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	13252845	13253278	13252954	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	57627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	15782024	15782386	15782102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6K23.1	191563	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	15916950	15917280	15917185	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	115983	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B,C12orf39	NA	NA	NA	NA	C12orf39	10863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	22482741	22482768	22482755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA1	105207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	24993015	24993329	24993020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	125109	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	18150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	25445837	25446089	25445962	Y	BCAT1	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	43967	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	27931494	27931809	27931627	Y	MANSC4	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS35	69788	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	29194633	29194954	29194755	Y	NA	NA	CCDC91	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	105082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,SPATS2	NA	NA	NA	NA	C1QL4	10999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	52418719	52418897	52418793	Y	NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4103	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	NA	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	C12orf44	79934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	135746	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	213013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	213625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	53445016	53445392	53445120	Y	IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3	EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6	NA	NA	NA	NA	RP11-983P16.4	830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	54149784	54149995	54149877	Y	PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	30255	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	2387	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	56356198	56356265	56356248	Y	CDK2,PMEL	DGKA,WIBG,CDK2,PMEL,RAB5B,SUOX,IKZF4	NA	NA	NA	NA	CDK2	2288	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	56876109	56876291	56876201	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	3907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.3454206560601
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	58819259	58819609	58819396	Y	LRIG3,LRIG3	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	485935	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	58903110	58903474	58903296	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	408829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	4215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	30739	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	63115696	63115706	63115701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	121164	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	130442	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	66025227	66025796	66025503	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	30578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53280	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr12	66289506	66290040	66289751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	50219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	68932536	68932735	68932704	Y	NA	NA	MDM1	IMR90	Hi-C	24141950	RAP1B	69884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.49200944706386
chr12	69316243	69316419	69316405	Y	RAP1B,CPM,CPM	CPM	NA	NA	NA	NA	CPM	46931	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6,RP11-1143G9.2	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	72236663	72237026	72236820	Y	NA	TBC1D15	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	5176	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	74257635	74257658	74257647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-81H3.2	536657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	75571924	75571966	75571945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPS2	210742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	75955852	75956146	75955999	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	52436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76045179	76045405	76045348	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	141763	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76060831	76060974	76060901	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	157415	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76114737	76114966	76114777	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	211321	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76116548	76116691	76116626	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	213132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76153718	76154163	76153855	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	250302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.98401889412772
chr12	76283192	76283327	76283260	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	142385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76363545	76363908	76363622	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	61804	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	77771188	77771377	77771281	Y	CSRP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	54767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	758112	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	79462781	79463098	79462967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	619779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	89740084	89740418	89740292	Y	POC1B,ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	4630	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	92419313	92419515	92419511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	115175	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	92836682	92836892	92836798	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	299009	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	92962605	92962800	92962697	Y	EEA1,BTG1,CLLU1OS	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EEA1	358307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	93561648	93561951	93561715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	86197	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	93827795	93828172	93827984	Y	NA	UBE2N,MRPL42	NA	NA	NA	NA	UBE2N	5866	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	94170549	94170892	94170731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	101398	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	94178297	94178734	94178344	Y	CRADD	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109146	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	94241673	94241891	94241710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	172522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	137747	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	95100273	95100466	95100365	Y	NA	NA	PLXNC1,CCDC41,NDUFA12,TMCC3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC41	248509	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	96631530	96631765	96631742	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	45370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A7P1	55341	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	99277133	99277249	99277231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	240214	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	104912129	104912512	104912321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	65056	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	104972349	104972459	104972427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	125276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	104998326	104998912	104998568	Y	TXNRD1,EID3,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	151253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	104999582	105000032	104999671	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	152509	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	105061987	105062372	105062098	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	214914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	105177272	105177383	105177327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	173139	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	108920909	108921183	108921031	Y	NA	FICD,SART3,ISCU	NA	NA	NA	NA	FICD	13947	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	69211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109083720	109083964	109083780	Y	SSH1	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	39408	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	110517321	110517546	110517448	Y	ARPC3	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	7830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.49200944706386
chr12	111847615	111848064	111847953	Y	ALDH2,FAM109A,SH2B3	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	5863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	111866764	111867021	111866784	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	25012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	115107232	115107509	115107392	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	12460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	116590030	116590409	116590220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	122734	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	116930750	116930937	116930851	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00173	38290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	117375665	117375672	117375669	Y	NA	FBXW8	NA	NA	NA	NA	FBXW8	28904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	118795182	118795561	118795499	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	TAOK3	13189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	50122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	121566211	121566268	121566242	Y	P2RX4,CAMKK2,P2RX7	P2RX7	P2RX4,P2RX7	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	P2RX7	2354	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	121968421	121968751	121968672	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	48169	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM120B	23540	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.22495340208264
chr12	123134609	123134748	123134695	Y	CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DENR	100573	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	123563294	123563583	123563475	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	68979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	124511422	124511512	124511486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	56044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr12	127730069	127730271	127730149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	81397	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348564	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	133068109	133068464	133068122	Y	NA	MUC8,FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	3972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr12	133081785	133082122	133081909	Y	FBRSL1	MUC8,FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	17648	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	20624080	20624132	20624092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	93270	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	20704420	20704798	20704605	Y	NA	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	28390	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	10686	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	24613267	24613398	24613318	Y	SPATA13	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	151709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	24821440	24821584	24821512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	263364	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	28873154	28873233	28873194	Y	FLT1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	86504	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	32433681	32434084	32433895	Y	NA	EEF1DP3	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	14703	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	32470605	32470630	32470618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	51627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	33762622	33762899	33762709	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	159868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.25107493910894
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	35322323	35322497	35322408	Y	NBEA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	191927	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	35574872	35575244	35575038	Y	NBEA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	60448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	35835884	35836142	35836013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	321460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	38244184	38244266	38244225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	73203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	42140186	42140232	42140209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	256845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	42422497	42422720	42422629	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	421569	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.66471977509391
chr13	44329047	44329228	44329222	Y	NA	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	29816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	46688680	46689111	46688972	Y	ZC3H13,LCP1	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	63786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	46696032	46696143	46696084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	71138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	46724053	46724328	46724215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	59678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	46869807	46870189	46870040	Y	ZC3H13,LCP1,C13orf18	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC63	85724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	47149300	47149814	47149489	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	23997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLA2-AS1	109006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	49466956	49467118	49467007	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	80930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	50555707	50555861	50555784	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	12163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	50630657	50630910	50630784	Y	NA	MIR16-1,DLEU1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	9460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	52406665	52407091	52406817	Y	NA	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-327P2.5	30232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS36	100329	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	540675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr13	63622021	63622216	63622150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	1025928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	64596462	64596642	64596562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	51502	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2813190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3073881	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF5	358500	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	75882191	75882614	75882549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	171636	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	78427899	78428170	78428083	Y	NA	NA	EDNRB	IMR90	Hi-C	24141950	EDNRB	63733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	80936113	80936309	80936180	Y	NA	SPRY2	SPRY2	K562	ChIA-PET	22265404	SPRY2	23027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	95128334	95128746	95128451	Y	DCT	DCT	NA	NA	NA	NA	DCT	1190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr13	97765837	97765979	97765909	Y	NA	NA	MBNL2	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL2	105709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	97864377	97864530	97864454	Y	NA	MBNL2	MBNL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MBNL2	7158	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	97872304	97872639	97872450	Y	RAP2A,MBNL2	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	99974545	99974749	99974637	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	GPR18	62547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	102827333	102827727	102827645	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	419626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	104663923	104664083	104664030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	1168729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr13	107026666	107026873	107026771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	191639	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	109115794	109116062	109115942	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF13B	214206	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	666456	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.25107493910894
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	208817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	111040636	111040786	111040716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	83140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	92497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111212014	111212166	111212090	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	COL4A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111464605	111464817	111464711	Y	NA	NA	ING1,CARS2,CARKD,RAB20,ANKRD10,LINC00346,COL4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00346	55345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111568618	111569036	111568957	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	3202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	111841497	111841815	111841671	Y	ING1,ARHGEF7	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	76591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.07836461107889
chr13	113695694	113695999	113695800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	74556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	5805	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	25142710	25142963	25142951	Y	CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104E19.1	79781	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	25464405	25464804	25464526	Y	CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	52699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr14	25476676	25476861	25476696	Y	NA	STXBP6	NA	NA	NA	NA	STXBP6	40642	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	27998275	27998515	27998360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	958601	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	9686	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr14	32950745	32951147	32950873	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	859	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	31.3700012748039
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr14	32960734	32960879	32960775	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	8728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr14	33098616	33098902	33098649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	146610	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	33106586	33106949	33106623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	154580	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	33126424	33126565	33126444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	174418	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	33151520	33151608	33151564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	199514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	33171876	33172196	33172044	Y	AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	219870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	33194193	33194559	33194238	Y	AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	242187	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr14	35675118	35675537	35675232	Y	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	70302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	37233433	37233885	37233827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	108660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	174581	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	43989536	43989546	43989541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1374952	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	675222	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	52329207	52329783	52329305	Y	NA	GNG2	NA	NA	NA	NA	GNG2	38294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	52365324	52366071	52365347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	74411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	52389104	52389259	52389151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	64934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	53385393	53385542	53385402	Y	DDHD1	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	31611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	53421198	53421586	53421381	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	4045	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	54766683	54766924	54766911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN3	94643	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	55104908	55105113	55104939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	73093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	55120784	55121076	55120951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	88969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	55565052	55565329	55565247	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	MAPK1IP1L,LGALS3	LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	23499	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	55592942	55593103	55593023	Y	GCH1,FBXO34,FBXO34	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	4114	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	59654580	59654708	59654599	Y	NA	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	1216	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	59800555	59800809	59800631	Y	GPR135	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	147191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	61654939	61655124	61655060	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	2662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	65148642	65149174	65148980	Y	HSPA2,FNTB	PLEKHG3	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG3	19646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	65224783	65224915	65224850	Y	ZBTB1,PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	55963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	65512172	65512469	65512321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAX	54944	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	66516389	66516661	66516525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	455464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68281633	68281808	68281770	Y	PLEK2,ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	ZFYVE26	326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68677466	68677903	68677626	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	209010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68844207	68844566	68844276	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	42347	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68864511	68864831	68864664	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	22082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	68868650	68868995	68868704	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	17918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	69241519	69241814	69241672	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	19376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	69281323	69281785	69281441	Y	DCAF5	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	20133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	69377319	69377610	69377464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	69472543	69472713	69472613	Y	NA	ACTN1	DCAF5,ACTN1	IMR90	Hi-C	24141950	ACTN1	28386	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	71425019	71425182	71425094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNX	52897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	74228325	74228451	74228378	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	23612	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	76334268	76334588	76334390	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	31891	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	76395057	76395394	76395222	Y	ESRRB,TGFB3	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	28578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	77388817	77389330	77389083	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	37724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	77444143	77444725	77444469	Y	NA	RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.1	11117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77451554	77451690	77451632	Y	NA	RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL,KIAA1737	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.1	18528	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	81597072	81597358	81597215	Y	STON2,TSHR	RP11-114N19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-114N19.3	37400	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.10448614810518
chr14	85938388	85938484	85938398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	55848	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	85978533	85978728	85978633	Y	FLRT2	RP11-497E19.1,FLRT2	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	15604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	88469787	88470067	88469992	Y	GALC,GPR65	GALC	NA	NA	NA	NA	GALC	11778	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	93120324	93121044	93120864	Y	ITPK1,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	92003	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	93475811	93476205	93475939	Y	RIN3,KIAA1409	NA	NA	NA	NA	NA	CHGA	88386	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	93540322	93540650	93540529	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	40015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG2B	88473	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	101083978	101084167	101084079	Y	NA	BEGAIN	WDR25,BEGAIN,RTL1,MIR665,MIR136,MIR337,MIR432,MIR433,MIR127,MIR431,MIR493,WARS	IMR90	Hi-C	24141950	BEGAIN	32228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	PPP2R5C	37259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.49200944706386
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	102530459	102530762	102530662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	73078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	104356058	104356494	104356205	Y	TRMT61A,PPP1R13B	PPP1R13B,C14orf2	PPP1R13B,LOC145216	MCF7	ChIA-PET	22265404	C14orf2	36112	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	4812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105368048	105368162	105368106	Y	NA	PLD4	NA	NA	NA	NA	PLD4	20991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105399879	105400289	105400091	Y	NA	PLD4,AHNAK2,C14orf79	NA	NA	NA	NA	PLD4	10726	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105500263	105500628	105500453	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	14778	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	6059	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	C14orf80	5167	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	21914435	21914569	21914482	Y	OR4N4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	916826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	23666486	23666631	23666558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEL2	222544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	32962221	32962756	32962661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	56876	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	33132037	33132132	33132085	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	226692	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33133022	33133309	33133285	Y	GREM1	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	227677	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33169920	33170257	33170055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	264575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	33437895	33438002	33437965	Y	NA	NA	FMN1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	532550	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	33440518	33440847	33440783	Y	NA	NA	FMN1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	535173	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8A,GOLGA8B	71262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	35014105	35014549	35014217	Y	NA	NA	AQR,GJD2	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA8A,GOLGA8B	135401	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	37278170	37278456	37278428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	111084	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	RP11-346D14.1,SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	40180090	40180249	40180216	Y	NA	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	44098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr15	40390220	40390395	40390296	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	8698	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	41074954	41075332	41075143	Y	NA	GCHFR,ZFYVE19,DNAJC17	NA	NA	NA	NA	GCHFR	20736	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	42968495	42968534	42968520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	58790	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	55940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	49189398	49189493	49189438	Y	SECISBP2L	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	21315	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	51535974	51536234	51536151	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	140501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	53010328	53010576	53010452	Y	NA	NA	MYO5C,FAM214A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARPP19	150248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	58521788	58521987	58521861	Y	LIPC	NA	SLTM,ADAM10,LIPC,FAM63B	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	518190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	59642348	59642705	59642508	Y	BNIP2,RNF111	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	20187	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	60290457	60290765	60290708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP6	231914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	24.1871505156198
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	64960104	64960464	64960341	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	33016	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	65135268	65135743	65135404	Y	TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	3180	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr15	65589242	65589632	65589437	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PARP16	1324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	66006814	66006895	66006855	Y	NA	RAB11A	SLC24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11A	9497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	67468171	67468380	67468281	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	77153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	56647	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	55087	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	68579972	68580192	68580087	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	11831	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	68657439	68657730	68657635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	89298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	69376017	69376173	69376096	Y	NA	LINC00277	NA	NA	NA	NA	LINC00277	12751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	MYO9A	39615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	76045531	76045710	76045600	Y	MAN2C1	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	16567	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	76901664	76901845	76901842	Y	SCAPER	NA	NA	NA	NA	NA	ISL2	274599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	78598854	78599004	78598959	Y	NA	WDR61	WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR61	8718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	80303455	80303586	80303521	Y	ZFAND6,BCL2A1	BCL2A1,ZFAND6	FAH,ZFAND6,ST20-MTHFS,MTHFS	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2A1	41667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	80697752	80697924	80697805	Y	ARNT2	ARNT2	NA	NA	NA	NA	ARNT2	3060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr15	80816171	80816419	80816261	Y	ARNT2,KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	121479	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	80931217	80931542	80931410	Y	MESDC1	NA	FAM108C1,ARNT2,KIAA1199	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1199	138142	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr15	83231949	83232133	83232017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB1	83479	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	83683877	83683893	83683890	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	5484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	85131508	85131753	85131631	Y	PDE8A	ZSCAN2	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	10464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	88021101	88021401	88021180	Y	NA	NA	NTRK3,AGBL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00052	96759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	90938187	90938493	90938325	Y	NA	ZNF774,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	8737	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	92481402	92481730	92481524	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	86477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	93131436	93131762	93131609	Y	RGMA,C15orf32,FAM174B	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	121215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	93142854	93143118	93142986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	109859	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	37903	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	93424689	93424786	93424732	Y	CHD2	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	96103160	96103444	96103266	Y	NA	NA	NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	763723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	96884534	96884884	96884709	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	MIR1469	10044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	98304362	98304376	98304369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	156408	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99091450	99092159	99091603	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98041	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99358585	99358846	99358731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	168385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr15	99383120	99383528	99383461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	192920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	228628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr15	101564329	101564758	101564573	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	LRRK1	106909	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	101631799	101632179	101632024	Y	CHSY1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-424I19.2	74556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	101745424	101745566	101745486	Y	TM2D3,CHSY1	RP11-424I19.2,CHSY1	NA	NA	NA	NA	RP11-424I19.2	38689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	374933	375274	375175	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25399	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	2537919	2538152	2538037	Y	PDPK1	C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	14772	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	4010667	4011135	4010934	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	81940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	11059393	11059782	11059502	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	23048	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr16	11726508	11726794	11726693	Y	NA	LITAF,SNN	CLEC16A,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	1443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	15238136	15238371	15238252	Y	NA	PKD1P6	NA	NA	NA	NA	PKD1P6	8050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	17328915	17329184	17329121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	233554	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	63250	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM159	127465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM159	145340	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	23963300	23964011	23963518	Y	GGA2,PRKCB	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	276323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	24268597	24268888	24268833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP6	278126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	27386500	27386691	27386620	Y	C16orf82,IL21R,IL4R	NA	NA	NA	NA	NA	IL4R	63511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF688	2212	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.3454206560601
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	46792369	46792477	46792422	Y	MYLK3	NA	MYLK3,C16orf87	IMR90	Hi-C	24141950	ORC6	70814	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	46920520	46920743	46920636	Y	NA	GPT2	NA	NA	NA	NA	GPT2	4230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	50236881	50237262	50237048	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	40786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	50554457	50554868	50554623	Y	BRD7,NKD1	NKD1	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	25373	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	55544017	55544378	55544293	Y	MMP2,LPCAT2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	3107	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	56333183	56333452	56333378	Y	MT3,CES5A,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAO1	109881	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	56882732	56883304	56883026	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD1	80656	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	57541705	57541726	57541715	Y	NA	POLR2C,DOK4,CCDC102A	POLR2C,DOK4,COQ9,CIAPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	DOK4	22466	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr16	66659405	66659873	66659770	Y	NA	CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	23628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	67047765	67048035	67047886	Y	FBXL8,CES4A	CBFB	NA	NA	NA	NA	CBFB	12984	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr16	70759138	70759547	70759396	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	41169	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	70783169	70783447	70783290	Y	NA	VAC14	NA	NA	NA	NA	VAC14	49617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMFBP1	250381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	73156810	73157218	73157149	Y	NA	NA	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	65213	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	79414931	79415415	79415101	Y	MAF	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	217196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	79802428	79802570	79802497	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	169817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	485636	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	487226	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	HSDL1	637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	84305711	84305761	84305735	Y	NA	WFDC1	ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609	IMR90	Hi-C	24141950	WFDC1	20491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	84633108	84633501	84633306	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	16182	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	84674948	84675055	84674964	Y	KLHL36	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	5076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	84677292	84677600	84677448	Y	NA	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2531	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	85343472	85343805	85343554	Y	KIAA0513	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	284097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	86797610	86797756	86797704	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31,MAP1LC3B	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	210769	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87811234	87811383	87811309	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13636	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87843209	87843416	87843290	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	45611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	89241276	89241597	89241419	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	CDH15	5101	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	89423849	89423969	89423923	Y	CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	131000	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	942821	943085	942871	Y	MYO1C	TIMM22	NA	NA	NA	NA	TIMM22	44464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	1100738	1101160	1100939	Y	SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	ABR	YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	29155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	1626372	1626653	1626476	Y	CRK,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	7904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	1667462	1668045	1667797	Y	PITPNA,SLC43A2,WDR81,WDR81	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	4209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	1994416	1994643	1994603	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	OVCA2	51089	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	2809424	2809858	2809669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	314920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	6962456	6962610	6962533	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	SLC16A13	25062	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	6.01014043115402
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	KRBA2,RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	KRBA2	9138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8762126	8762262	8762190	Y	PIK3R5,PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	160597	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	8762730	8763052	8762926	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R6	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	159807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	233065	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	9952344	9952516	9952448	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	207563	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	253375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	12295	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	15313128	15313509	15313354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMP22	146485	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR1	69751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	16419408	16419751	16419580	Y	NA	FAM211A	FAM211A,CENPV,UBB,TRPV2,C17orf76-AS1,ZNF287	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211A	25941	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	17098696	17098916	17098799	Y	MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN	PLD6,FLCN	NA	NA	NA	NA	PLD6	8713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17208754	17209324	17209000	Y	PLD6,COPS3,COPS3,NT5M	COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	NT5M	4105	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17601204	17601406	17601306	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	18417	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	17615930	17616232	17616056	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	33143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	17628792	17629315	17629145	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	46005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	17752508	17752712	17752608	Y	RASD1,PEMT	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	14183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	17862888	17863023	17862956	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	10713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	18032331	18032623	18032472	Y	TOM1L2,MYO15A	DRG2	NA	NA	NA	NA	DRG2	43131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	20012372	20012672	20012482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	101715	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26214261	26214593	26214427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	152170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26277984	26278379	26278193	Y	SEBOX	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	88384	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	19395	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2A	49870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	29886835	29887094	29886884	Y	EVI2A	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	170193	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	30844051	30844402	30844343	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	32414	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	30850461	30850579	30850547	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	38824	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33179831	33179955	33179851	Y	NA	NA	SLC35G3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	106594	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	SLFN12	NA	NA	NA	NA	SLFN12	28406	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12	NA	NA	NA	NA	SLFN12	29106	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	34203240	34203349	34203295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDM1	52428	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	SRCIN1	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	SRCIN1	11773	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	36758537	36758835	36758687	Y	NA	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	1348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	38226807	38227182	38226872	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	38468655	38468865	38468706	Y	IKZF3,CCR7	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	5211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	38502716	38503032	38502793	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	39272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	NA	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP4	77176	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	39218168	39218609	39218458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP4-12	59810	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	39832714	39833014	39832798	Y	RAB5C,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1	EIF1	SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF1	10123	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	40608913	40609089	40609017	Y	NA	PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	51	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	40805539	40806065	40805782	Y	NA	TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	3258	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.78518702907137
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	41847666	41848033	41847850	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	6323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.49200944706386
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	42861642	42861917	42861696	Y	NA	ADAM11,GJC1	NA	NA	NA	NA	ADAM11	27243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	43084352	43084694	43084637	Y	NA	C1QL1,NMT1	NA	NA	NA	NA	C1QL1	40913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	44019661	44020036	44019768	Y	STH,CRHR1,MAPT	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	49913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	44342171	44342447	44342244	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPT	372423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	11539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	46079914	46080281	46080131	Y	NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	33111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	46318516	46318700	46318601	Y	SKAP1,HOXB4	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	139797	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	46510529	46510724	46510608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS1	108189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	9519	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	27085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,HILS1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	48421685	48421964	48421826	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1	NA	NA	NA	NA	XYLT2	232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	53047778	53047982	53047880	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	COX11	3632	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.10448614810518
chr17	55518270	55518753	55518516	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	187058	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56110025	56110231	56110193	Y	NA	VEZF1,SRSF1,DYNLL2	AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	SRSF1	27318	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56391648	56391970	56391957	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	36484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56696420	56696582	56696517	Y	NA	RNU1-60P	C17orf47,SEPT4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-60P	38084	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	58467674	58467818	58467746	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	30013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	59327837	59328038	59327938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	147219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	59328360	59328558	59328442	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	146699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	59337920	59337981	59337951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	137276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	59398606	59399069	59398760	Y	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	76188	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	270370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr17	61323201	61323584	61323320	Y	NA	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	198155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61629052	61629111	61629082	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	3230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	19950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	62252131	62252624	62252334	Y	LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	ERN1,SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	30688	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	63179961	63180187	63180056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	129004	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	64536278	64536639	64536325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	239524	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	65254064	65254307	65254144	Y	HELZ	HELZ	HELZ	MCF7	ChIA-PET	22265404	HELZ	13959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	65708047	65708170	65708124	Y	NA	NOL11	NA	NA	NA	NA	NOL11	3779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	66030294	66030564	66030453	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	659	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66348483	66348670	66348577	Y	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	63075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	66380161	66380700	66380381	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	WIPI1	70954	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66384429	66384662	66384544	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	66992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	66421215	66421317	66421250	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	30337	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66452097	66452412	66452224	Y	SLC16A6	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr17	66576283	66577056	66576544	Y	FAM20A	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	70362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	188409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	67089514	67089753	67089674	Y	ABCA6	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA8	139981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	67577769	67578023	67578007	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	168930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	68133591	68133755	68133649	Y	KCNJ2	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	29059	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	69550514	69550549	69550532	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	64570	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	179740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	201238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70432780	70433062	70433017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	188308	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr17	70483632	70483939	70483786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	137431	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	70610080	70610203	70610142	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	LOC100499467	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPL32P33	11167	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	70628447	70628581	70628499	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	6030	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	72595328	72595714	72595383	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,SLC16A5,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	147077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	72837172	72837380	72837244	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	29776	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	74525125	74525268	74525197	Y	NA	RHBDF2,CYGB,SNORD1B	NA	NA	NA	NA	CYGB	19989	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	74525516	74525637	74525615	Y	NA	RHBDF2,CYGB,SNORD1B	NA	NA	NA	NA	CYGB	19620	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2,CYGB,SNORD1B	NA	NA	NA	NA	CYGB	19178	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2,CYGB,SNORD1B	NA	NA	NA	NA	CYGB	18507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	74593962	74594390	74594127	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6	CYGB,SNORD1B,ST6GALNAC2	ST6GALNAC2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ST6GALNAC2	12924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	74696685	74696955	74696820	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	8143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237408	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237797	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	75421302	75421687	75421325	Y	SEPT9,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	340504	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	75451587	75451956	75451821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	370789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	75468767	75469129	75469011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	387969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	15.0986454733869
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	76412850	76413399	76413170	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	40129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	15794	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	77916401	77916581	77916489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	91066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	77961931	77962339	77962251	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	45308	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	78102448	78102482	78102466	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	16500	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.66471977509391
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	35205	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	36737	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	37096	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	79358751	79359583	79359338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	77703	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	12.7532248173268
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	79360	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	81697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	84012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	88526	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	89706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	79448388	79448678	79448571	Y	NPB,AATK,AZI1,BAHCC1	ACTG1	NA	NA	NA	NA	ACTG1	40195	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	79789691	79790066	79789800	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr17	80199457	80199968	80199484	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	15184	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr17	81057799	81057924	81057864	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	22232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYOM1,MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	4135348	4135809	4135745	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	725742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	4356734	4357177	4357014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	947128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	4453597	4454207	4453941	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	1043991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	5584856	5584964	5584919	Y	EPB41L3	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	43735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr18	7460129	7460467	7460298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	104313	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	7512213	7512497	7512355	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRM	52283	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	9095289	9095558	9095498	Y	RALBP1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDUFV2	5070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	10766591	10766813	10766750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	242689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	254726	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	12455577	12455852	12455727	Y	NA	SLMO1	NA	NA	NA	NA	SLMO1	49682	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76	NA	NA	NA	NA	CEP76	21339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	26808	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	21975077	21975273	21975220	Y	OSBPL1A	OSBPL1A,IMPACT	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	571	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	32622568	32623026	32622758	Y	ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	67676	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr18	35188178	35188197	35188187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	781020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	42205298	42205485	42205392	Y	NA	NA	SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	SETBP1	52653	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	42686338	42686675	42686545	Y	NA	NA	SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	SETBP1	428200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	42857952	42858246	42858076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	599814	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	43542357	43542726	43542619	Y	PSTPIP2,C18orf25,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	2514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	45121488	45121559	45121552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	333956	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	286345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	46382446	46382625	46382534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	319029	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	397724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	46467138	46467469	46467322	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	403721	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	46590447	46590707	46590577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	395010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	51151759	51152047	51151782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	597111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	55893671	55893850	55893725	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	184072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	55957381	55957780	55957581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	247782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	56159165	56159246	56159180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	106617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	57552932	57553277	57553219	Y	PMAIP1	PMAIP1	PMAIP1	K562	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	11903	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr18	60828947	60829338	60829223	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	156023	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr18	60864948	60865713	60864996	Y	PHLPP1,VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	119648	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	60874386	60874946	60874584	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	110415	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	60903050	60903417	60903276	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	81944	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	63434118	63434346	63434234	Y	CDH7	CDH7	NA	NA	NA	NA	CDH7	18630	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	70814652	70814839	70814746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	998261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	72424911	72425171	72425041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	161805	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	34926	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74818309	74818676	74818510	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	24963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74819276	74819721	74819374	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	23918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	74821198	74821567	74821500	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	22072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74823541	74824614	74824455	Y	NA	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	19025	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.95789735710143
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	12830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	5656	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74840150	74840705	74840388	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	2934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr18	74841905	74842663	74842144	Y	MBP	MBP	NA	NA	NA	NA	MBP	976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	74921028	74921148	74921053	Y	MBP	NA	MBP	IMR90	Hi-C	24141950	MBP	77389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	76617514	76617912	76617823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	209373	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr18	77616666	77616803	77616722	Y	NA	NA	KCNG2,CTDP1,PQLC1	IMR90	Hi-C	24141950	PQLC1	92861	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	342831	343179	342882	Y	MIER2	MIER2	NA	NA	NA	NA	MIER2	33	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	1410481	1410741	1410600	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	4913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	APC2	982	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	1840916	1841078	1840939	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16	NA	NA	NA	NA	REXO1	5374	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr19	1895445	1895653	1895520	Y	OAZ1,DOT1L,CSNK1G2	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	BTBD2,CSNK1G2,KLF16	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAMP4	7560	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	2549602	2550221	2549903	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	75482	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	3314117	3314647	3314306	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	42914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	3397236	3397600	3397594	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	39675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr19	3969049	3969183	3969116	Y	NA	SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	DAPK3	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	4785303	4785662	4785510	Y	FSD1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	FEM1A	4066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	5940860	5941142	5941001	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	CAPS	31142	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	7196747	7197124	7196928	Y	KIAA1543,INSR	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94921	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	7483723	7483869	7483787	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	25724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	8272965	8273383	8273152	Y	NA	CERS4	NA	NA	NA	NA	CERS4	3345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	C19orf66	NA	NA	NA	NA	C19orf66	46518	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,C19orf38,CARM1	NA	NA	NA	NA	C19orf38	4006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	10987245	10987998	10987563	Y	NA	TMED1,C19orf38,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7056	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	11675625	11675958	11675811	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627,ACP5	NA	NA	NA	NA	ZNF627	7436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13140737	13141121	13140967	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	36315	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	47005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	13171487	13171654	13171570	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	40321	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WIZ	107904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr19	16557779	16558043	16557912	Y	RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	22853	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	17236053	17237400	17237360	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	51462	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18264934	18265291	18265179	Y	NA	PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	PIK3R2	2966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	JUND	11955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	18589714	18590055	18589946	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	40882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,KLHL26	NA	NA	NA	NA	KLHL26	23010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	19571175	19572073	19571752	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	52472	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	121713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	28218670	28219232	28218933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1483216	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	28334161	28334293	28334227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1368155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	30334727	30335004	30334899	Y	NA	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	33922	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	30718140	30718340	30718240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	305589	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPA,CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	34259901	34260068	34259985	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	24770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	34760936	34761338	34761013	Y	LSM14A,KIAA0355	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	17494	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	35600610	35600880	35600779	Y	MAG,ZNF302,ZNF181,ZNF30,SCN1B,HPN,LGI4,FXYD7,FXYD1	FXYD3,FXYD1,LGI4,FXYD7,FXYD5	LOC100128675	K562	ChIA-PET	22265404	FXYD3	3852	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr19	35880330	35880634	35880484	Y	ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,CD22	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	121926	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	35927378	35927883	35927593	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,HCST,FFAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DMKN	74677	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	39166302	39166492	39166383	Y	LGALS7B	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	30013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	40849279	40849406	40849342	Y	NA	PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	2957	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	CEACAM21	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	25521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	16218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	15573	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.83743010312396
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,CD79A,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	CD79A	385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1,APOC1P1	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	45447166	45447474	45447219	Y	NA	APOE,APOC1,APOC1P1,CLPTM1	NA	NA	NA	NA	APOC2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.81130856609767
chr19	45606484	45606609	45606525	Y	CEACAM16,FOSB,RELB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	13830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	46398825	46399093	46398978	Y	EML2,EML2	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	MYPOP	4769	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	46688176	46688573	46688180	Y	PTGIR	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	159678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	59077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	46930027	46930174	46930086	Y	NA	PNMAL1	CCDC8,LOC100506012	IMR90	Hi-C	24141950	PNMAL1	42646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	47394206	47394341	47394251	Y	NA	AP2S1	ARHGAP35,SAE1,NPAS1,TMEM160,ZC3H4,FKRP,STRN4,PRKD2,SLC1A5,SNAR-E,AP2S1	IMR90	Hi-C	24141950	AP2S1	41957	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	48625125	48625566	48625247	Y	NA	PLA2G4C,LIG1	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	13051	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	SLC17A7	19141	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9639	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	51111018	51111676	51111369	Y	NA	LRRC4B,C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	39026	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	51197974	51198378	51198356	Y	NA	C19orf81,SHANK1,CLEC11A	NA	NA	NA	NA	SHANK1	22329	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr19	52227755	52228377	52227966	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	155204	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,AC008753.6,CACNG7	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	3374	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	54981954	54982383	54982298	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	28	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	55798938	55799371	55799231	Y	SYT5,SHISA7,BRSK1	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1,SUV420H2	NA	NA	NA	NA	BRSK1	7498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr19	55962647	55962935	55962813	Y	SYT5,BRSK1,ZNF580,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ISOC2	8775	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF671	18379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	314323	314661	314512	Y	NA	NA	SNTG2	IMR90	Hi-C	24141950	ACP1	52183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	3072634	3072961	3072804	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	306692	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	8422131	8422275	8422172	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	394700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	8800235	8800500	8800331	Y	NA	ID2,AC011747.7	LOC339788,LINC00299,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	16475	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	9692579	9693026	9692911	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	895	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16136	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	12308947	12309431	12309189	Y	LPIN1	NA	TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	AC096559.1	322199	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	12455448	12455618	12455525	Y	TRIB2	NA	LOC100506474,MIR4262,TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	399397	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr2	12538008	12538228	12538087	Y	TRIB2	NA	LPIN1,LOC100506474,TRIB2,MIR4262	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	316787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.49200944706386
chr2	12860025	12860219	12860122	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	5010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	12964548	12964753	12964651	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	109533	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	13069256	13069287	13069272	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1,MIR4262	IMR90	Hi-C	24141950	AC064875.2	75851	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	16219682	16220075	16219855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	211619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf44	56498	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	25789731	25789834	25789815	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	104669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	49345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	28856660	28856889	28856764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	115617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	30625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	30594059	30594375	30594217	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LCLAT1	73717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	30644745	30644849	30644777	Y	NA	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	23243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	30807812	30808169	30807846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	139720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37847073	37847432	37847190	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	116179	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	38212559	38212760	38212660	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	243950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	82480	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	38735582	38735946	38735766	Y	NA	RPLP0P6	ATL2,GALM,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPLP0P6	28662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	38888613	38888771	38888720	Y	ARHGEF33	GALM	NA	NA	NA	NA	GALM	2281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	39443973	39444333	39444109	Y	SOS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	94487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	39719153	39719730	39719398	Y	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	56700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	42351253	42351626	42351357	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	42864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	280047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	43560766	43560944	43560854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	109018	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	43685237	43685474	43685356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135711	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	47979563	47979754	47979705	Y	NA	NA	KCNK12,MSH2,MSH6	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	58894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	48373241	48373406	48373298	Y	FOXN2	NA	FOXN2,PPP1R21	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	166370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	54285444	54285567	54285472	Y	NA	NA	SPTBN1,EML6,PSME4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	89467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	54682152	54682577	54682442	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	730	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	54751942	54752182	54752042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	70520	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	164425	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	54861793	54862155	54861956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	180371	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	55360803	55361407	55361172	Y	SMEK2,CCDC88A,RTN4	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	23046	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	56116145	56116275	56116210	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	32999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr2	62803591	62803729	62803643	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	66562	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	65081925	65082185	65082093	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	105786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr2	65782552	65782570	65782560	Y	NA	NA	SPRED2,ACTR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRED2	124781	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	143315	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	69260768	69260862	69260820	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	22458	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	69481133	69481450	69481229	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	130932	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	71944095	71944430	71944253	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	265243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	75043732	75043824	75043778	Y	NA	HK2	HK2,SEMA4F	IMR90	Hi-C	24141950	HK2	15284	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	75779311	75779317	75779314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	92592	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	75836166	75836348	75836343	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	35561	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1393267	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1432686	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	84260622	84260661	84260642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	424508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	RETSAT	84801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2A	91003	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	6246	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	86048153	86048345	86048249	Y	ATOH8	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	65792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	92317324	92317742	92317530	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	3328162	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	99250910	99251133	99251091	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	27868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	100412009	100412328	100412169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	307512	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr2	100576722	100576856	100576853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	455262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	100654601	100654935	100654768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	377183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	101197262	101197669	101197547	Y	RPL31	PDCL3	NA	NA	NA	NA	PDCL3	20110	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	101669826	101670190	101670079	Y	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	53649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	102549846	102550051	102549852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	238534	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	105119494	105119751	105119616	Y	POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	532690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	458145	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	109883526	109883741	109883650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	482313	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	101146	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	113563232	113563409	113563324	Y	IL36G,IL1RN	CKAP2L,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	29071	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	113637417	113638142	113637790	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	44937	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	113924878	113925123	113925003	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2	PAX8-AS1	PSD4	K562	ChIA-PET	22265404	PAX8-AS1	41976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	165331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	120960813	120961129	120961026	Y	TMEM185B,RALB	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	17855	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	121334562	121334634	121334591	Y	NA	NA	LOC84931	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	156565	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	127862933	127863341	127863123	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	2	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	128651321	128651407	128651347	Y	PROC,LIMS2,AMMECR1L	POLR2D	SAP130	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2D	37590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	133803546	133803723	133803632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	376394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	134433950	134434204	134434157	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5	441350	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	136217422	136217690	136217556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	69116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	261927	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.98401889412772
chr2	144941420	144941641	144941519	Y	GTDC1,ZEB2,GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	146494	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr2	145136238	145136489	145136344	Y	ZEB2	GTDC1	NA	NA	NA	NA	GTDC1	48103	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	145794026	145794356	145794065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	370492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	145795788	145796304	145796070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	372254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	145821367	145821376	145821372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	397833	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	145866626	145866907	145866723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	443092	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	145942500	145942836	145942668	Y	NA	NA	ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	TEX41	518966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	145998951	145999148	145999049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	575417	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	149372340	149372450	149372396	Y	EPC2	EPC2	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	EPC2	27559	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	KIF5C	102882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	150314581	150314916	150314749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMADHC	127414	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	150505364	150505670	150505432	Y	NA	NA	RBM43,RND3	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	63034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	153319384	153319598	153319488	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	129633	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr2	159855059	159855514	159855150	Y	NA	TANC1	NA	NA	NA	NA	TANC1	31913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	159908773	159909006	159908845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANC1	85627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	159951081	159951241	159951194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANC1	127935	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	160491864	160492115	160492090	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	BAZ2B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAZ2B	20661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	161238176	161238388	161238285	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	24005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	161244338	161244737	161244615	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	17656	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD14	67138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	164486140	164486494	164486462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	104028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	164553215	164553632	164553445	Y	NA	FIGN	NA	NA	NA	NA	FIGN	36890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	SLC38A11	NA	NA	NA	NA	SLC38A11	32827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3,AC009495.4	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	170218108	170218468	170218381	Y	NA	LRP2	NA	NA	NA	NA	LRP2	913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	171222273	171222592	171222467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007405.4	402684	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	172958586	172958929	172958756	Y	DYNC1I2,DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	6699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	175458304	175458790	175458407	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF1	86854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	73342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	81223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	176846427	176846539	176846507	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	19028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4,AC009336.24,HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	HOXD1	3990	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	179487942	179488336	179488251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	104032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	179692765	179693175	179692935	Y	NA	TTN	NA	NA	NA	NA	TTN	354	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	182089643	182089935	182089741	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	AC104820.2	124984	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	189392634	189392951	189392670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	238238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR75	289007	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	190405139	190405272	190405209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR75	100980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASNSD1	46031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	192030894	192031017	192030956	Y	NA	NA	STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	76894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	194212584	194212652	194212618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1154149	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	196336170	196336186	196336178	Y	NA	NA	SLC39A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC39A10	102515	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	197264939	197265165	197265058	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	AC020571.3	142191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	197936511	197936873	197936784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	145991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	198702876	198702992	198702942	Y	NA	PLCL1	NA	NA	NA	NA	PLCL1	35450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	199736102	199736481	199736292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	583942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	200328743	200328999	200328976	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2-AS1,SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	4990	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	201794314	201794594	201794537	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1	PPIL3,NIF3L1,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	31809	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10	NA	NA	NA	NA	CASP10	33756	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	ABI2	120687	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABI2	124323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	205037741	205037858	205037800	Y	NA	NA	PARD3B	IMR90	Hi-C	24141950	ICOS	238270	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	206563648	206564168	206563856	Y	INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	18934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	206569997	206570271	206570078	Y	NA	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	25283	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	206571507	206572136	206571741	Y	NRP2,INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	26793	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	207348794	207348941	207348896	Y	NA	ADAM23	NA	NA	NA	NA	ADAM23	42531	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF7	146055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	208195614	208195873	208195761	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	165623	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	168830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	208839036	208839224	208839180	Y	CREB1,FZD5,PIKFYVE,PLEKHM3	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	49060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	211470804	211470937	211470808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	130428	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	214053816	214053901	214053846	Y	NA	IKZF2	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	IKZF2	38665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	215735917	215736192	215736055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARD1	63489	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	216557446	216557685	216557585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	258470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	216870818	216871425	216871006	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	25394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	217639400	217639563	217639456	Y	NA	NA	DIRC3,TNS1,IGFBP5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP5	81152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	238872	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	218142226	218142611	218142295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	476705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	218518007	218518420	218518200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	100896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	218736007	218736119	218736065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	116691	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	219596297	219596622	219596516	Y	TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1	TTLL4,CYP27A1	NA	NA	NA	NA	TTLL4	22729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48175	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	222305020	222305156	222305087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	131766	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr2	223155643	223155970	223155818	Y	PAX3,CCDC140	PAX3	NA	NA	NA	NA	PAX3	5745	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	223157138	223157255	223157183	Y	PAX3,CCDC140	PAX3	NA	NA	NA	NA	PAX3	4460	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE4	89331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	224591304	224591516	224591410	Y	NA	NA	AP1S3	MCF7	ChIA-PET	22265404	AP1S3	109228	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr2	225010758	225010857	225010808	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	108722	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	225075172	225075344	225075265	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	173136	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr2	225720701	225721025	225720950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	184137	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	225813471	225813927	225813697	Y	CUL3	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	91235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	225848740	225848962	225848850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	56200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	225864044	225864445	225864307	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	40717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	227048517	227048542	227048530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	613933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	227331006	227331180	227331162	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	331295	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr2	227726085	227726127	227726089	Y	NA	RHBDD1	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	27788	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232026724	232026986	232026907	Y	NA	HTR2B,ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	34274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	232046537	232047112	232046768	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	14148	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232054877	232055306	232054968	Y	HTR2B,ARMC9	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	5954	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	232095962	232096104	232096033	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	34702	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232176481	232176522	232176502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC9	115221	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232254414	232254430	232254422	Y	NA	NA	B3GNT7	K562	ChIA-PET	22265404	SNORD82	68721	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	233654871	233654934	233654903	Y	NA	KCNJ13	NA	NA	NA	NA	KCNJ13	15593	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	234882556	234882776	234882660	Y	TRPM8	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM8	58513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	6.44990680416529
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	235244091	235244800	235244645	Y	ARL4C	NA	SPP2,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	158897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	235392262	235392984	235392812	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	10713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	235457689	235457991	235457840	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4,SPP2,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	53992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	508840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238218155	238218362	238218259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	173709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	239597207	239597573	239597401	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	263824	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	175294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	240173626	240173903	240173698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	147227	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	240179337	240179507	240179411	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	141623	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	240238754	240239047	240238989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	82083	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	240291335	240291754	240291620	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	29376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	76052	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	1396685	1396983	1396828	Y	SDCBP2,SIRPA	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	24879	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1757222	1757297	1757260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115857	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1792448	1792844	1792660	Y	NA	NA	STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	80310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr20	1869680	1870159	1869931	Y	NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	2995	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1876933	1877521	1877350	Y	SIRPB2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	3779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	1878572	1879041	1878847	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	5418	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	1925678	1926256	1925964	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	52524	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	2851057	2851398	2851292	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	8227	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	3348660	3349006	3348744	Y	FASTKD5,UBOX5,GFRA4	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	37266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	3993168	3993585	3993445	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	4148418	4148828	4148571	Y	NA	SMOX	NA	NA	NA	NA	SMOX	48791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	4931181	4931354	4931276	Y	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	57585	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	4954142	4954446	4954407	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	34493	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	5037420	5037933	5037775	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	SLC23A2	SLC23A2,C20orf30	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	48481	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	7998924	7999176	7999047	Y	NA	RP5-971N18.3,TMX4	NA	NA	NA	NA	TMX4	448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	8380615	8380981	8380808	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	269791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	9112642	9112699	9112675	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	65232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr20	14697041	14697213	14697128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	380779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	15282242	15282264	15282251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	965980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	15876480	15876870	15876712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	675208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr20	16331149	16331548	16331320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	220530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	21172590	21172944	21172681	Y	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	67966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NKX2-4	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-4	40354	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	25299092	25299564	25299289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	70055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	35887668	35888008	35887942	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	28033	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	35905068	35905696	35905172	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL	MANBAL	RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B	IMR90	Hi-C	24141950	MANBAL	10345	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	35972053	35972195	35972121	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	36343336	36343680	36343577	Y	MANBAL,SRC,RPRD1B,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	22928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,RP11-445H22.3	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-445H22.3	717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	96875	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	45324546	45324927	45324721	Y	TP53RK	TP53RK,SLC2A10	SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	TP53RK	8128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	34622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	47344986	47345424	47345132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	96996	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	47413863	47414232	47414047	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	28188	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48726581	48727101	48726820	Y	SPATA2,SPATA2	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	3395	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50027410	50027791	50027676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	321281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50033542	50033860	50033623	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	315212	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr20	50054102	50054305	50054204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	294767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50113765	50113981	50113873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	235091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50114638	50114822	50114734	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	234250	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	50145288	50145440	50145335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	203632	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50178083	50178314	50178273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	170758	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	168565	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	100689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	95991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	259269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	52516990	52517464	52517242	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	292544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	278815	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	54997703	54998108	54997901	Y	NA	AURKA,CSTF1	NA	NA	NA	NA	CSTF1	32276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr20	58402426	58402798	58402570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	103912	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	142529	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	58955192	58955446	58955319	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	294297	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	58964846	58965478	58965226	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	303951	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	60328357	60328661	60328509	Y	NA	RP11-429E11.2	NA	NA	NA	NA	RP11-429E11.2	245	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	7.18285075918407
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr20	61620731	61620885	61620812	Y	OGFR,DPH3P1	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	53427	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	121304	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.19883186505635
chr20	62676779	62676921	62676850	Y	SLC2A4RG,UCKL1,TCEA2,SOX18	ZNF512B,SOX18,TCEA2	NA	NA	NA	NA	ZNF512B	1192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	62820558	62820833	62820696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	64261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1207929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	11184749	11185145	11184947	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	1218164	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17444153	17444342	17444293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	210747	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17568022	17568137	17568068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	86952	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17681993	17682347	17682285	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	26904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17745935	17746301	17746052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	90846	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	251820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	17924273	17924626	17924451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	269184	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	17958916	17959192	17958984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	303827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	305578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	19157127	19157381	19157167	Y	BTG3,C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	32322	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	22572618	22572960	22572789	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	203985	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	28207147	28207505	28207325	Y	NA	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	8223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	29817449	29817753	29817663	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	437940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	30133752	30133937	30133845	Y	C21orf7,USP16,N6AMT1	NA	LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	121756	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	30142164	30142331	30142245	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00113,LTN1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	113362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	30557550	30557806	30557610	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	6586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	30580486	30581464	30581071	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	16094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	35308653	35309105	35308775	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	22369	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	35863434	35863747	35863591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000322.53	69170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	35891449	35891717	35891494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	93724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	35915930	35915933	35915932	Y	KCNE1,RCAN1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	69508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	36847397	36847674	36847465	Y	RUNX1	NA	RUNX1,LOC100506385,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	527291	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	36848062	36848516	36848174	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	526449	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	36937518	36937720	36937706	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	437245	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	19644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	38189032	38189251	38189142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	147561	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	41146916	41147071	41146994	Y	LCA5L	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	331135	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	52202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr21	42543184	42543509	42543444	Y	BACE2	BACE2	NA	NA	NA	NA	BACE2	5456	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr21	42610946	42611279	42611113	Y	BACE2	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	73218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	42743414	42743752	42743584	Y	NA	MX2	NA	NA	NA	NA	MX2	11544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr21	44765825	44766380	44766074	Y	PKNOX1	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	78628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	45154719	45155048	45154820	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	17744	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	46274069	46274460	46274264	Y	KRTAP12-4,UBE2G2,SUMO3	SUMO3,PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	17292	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	46294509	46294819	46294590	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	2757	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	46389792	46390113	46389960	Y	POFUT2,ITGB2	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	31867	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr21	46958930	46959319	46959135	Y	NA	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	3006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr21	48042238	48042469	48042310	Y	DIP2A,PRMT2	S100B,PRMT2	DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2	IMR90	Hi-C	24141950	PRMT2	10610	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	257381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	18349077	18349481	18349311	Y	SLC25A18,TUBA8,MICAL3	NA	NA	NA	NA	NA	BID	93541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	18538907	18539143	18539025	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19546	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	18539229	18539381	18539279	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19308	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr22	18629925	18630231	18630217	Y	NA	TUBA8,USP18	NA	NA	NA	NA	USP18	435	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.51813098409016
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	20142939	20143182	20143142	Y	NA	RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8	27960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	20258205	20258516	20258358	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	10253	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	21979927	21980091	21980009	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	YDJC	2262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	22231244	22231441	22231355	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	PPM1F	K562	ChIA-PET	22265404	MAPK1	11274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	23277682	23278181	23277858	Y	NA	NA	MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1	IMR90	Hi-C	24141950	GNAZ	132359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29469912	29470391	29470070	Y	XBP1,KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	2846	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	29471077	29471334	29471238	Y	KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	4011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29505815	29505935	29505933	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	38749	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29545879	29545979	29545929	Y	AP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	53861	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29548210	29548510	29548260	Y	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	51330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29548778	29549084	29549009	Y	XBP1,KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	50756	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	32614060	32614086	32614078	Y	DEPDC5,SLC5A1,SLC5A4	NA	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	180583	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	32819656	32819735	32819695	Y	RFPL3,TIMP3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	48928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	33202022	33202333	33202121	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	6335	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	37297352	37297636	37297579	Y	RAC2,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	NA	PVALB	83829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	37655075	37655389	37655235	Y	NA	RAC2	CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	16587	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	38012270	38012654	38012462	Y	NA	GGA1,SH3BP1,PDXP	NA	NA	NA	NA	GGA1	9789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23,SOX10	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	38413617	38413853	38413758	Y	SOX10	SOX10,PICK1	SOX10,POLR2F,PICK1,MAFF	IMR90	Hi-C	24141950	SOX10	32188	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	38434638	38434982	38434731	Y	NA	PICK1	BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1	IMR90	Hi-C	24141950	PICK1	15336	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr22	38572177	38572681	38572373	Y	DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	23208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	39631244	39631333	39631289	Y	PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	7423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	39635222	39635426	39635287	Y	SUN2,SUN2,CBX7,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	3330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	39693596	39693744	39693670	Y	MGAT3	RPL3	NA	NA	NA	NA	RPL3	20650	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	43165805	43166293	43166166	Y	NFAM1,ARFGAP3	NA	ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3	IMR90	Hi-C	24141950	ARFGAP3	85819	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	46393370	46393721	46393470	Y	C22orf26	NA	C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP6-109B7.3	53864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	176990	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	283617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	9.96803778825544
chr22	50331571	50331948	50331720	Y	MAPK12	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	20213	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	50336699	50336868	50336781	Y	SELO	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	15293	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr22	50414821	50415138	50414874	Y	BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIM3	62660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	50609711	50610057	50610042	Y	NA	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	2551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.19883186505635
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	5043972	5044716	5044216	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	24326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	12234951	12235397	12235194	Y	RAF1,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	91470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	12395386	12395555	12395486	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	68519	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	12567743	12567843	12567793	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	28670	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	14483107	14483358	14483285	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	41031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	15675662	15676068	15675826	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	34324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	16544909	16545021	16544965	Y	RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	8512	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	607005	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	25494741	25494759	25494749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	209639	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr3	28367464	28367703	28367584	Y	NA	AZI2,ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	AZI2	20915	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	28714856	28714947	28714902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	326219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	996	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	37240480	37240740	37240610	Y	NA	LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1	LRRFIP2,MLH1,GOLGA4	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	17300	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	41158856	41159369	41159156	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	74959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	42725545	42725856	42725623	Y	LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22C	84973	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	43519107	43519315	43519279	Y	SNRK	RP11-353H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	6057	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	44036592	44036799	44036686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	305506	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.54425252111645
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	90596	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	33855	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	45175300	45175656	45175542	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	24011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46036343	46036779	46036493	Y	CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	1027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46133292	46133548	46133397	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	97976	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46332561	46332856	46332710	Y	NA	NA	CCR3	IMR90	Hi-C	24141950	CCR1	84674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	72961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	48990226	48990305	48990298	Y	USP4	ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	35972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	49275888	49276379	49276160	Y	USP4,RHOA,AMIGO3,ARIH2,DALRD3	CCDC36	NA	NA	NA	NA	CCDC36	42027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	49382516	49382833	49382703	Y	ARIH2,DALRD3,UBA7,RHOA,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	6371	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	50243484	50243685	50243589	Y	HYAL1,SLC38A3	GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	18039	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	50472730	50473023	50472977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM115	77689	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	50629910	50630235	50630098	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	16716	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	52039668	52039907	52039792	Y	NA	PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29,DUSP7	RPL29	K562	ChIA-PET	22265404	RPL29	11710	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	52143667	52143964	52143845	Y	NA	POC1A	NA	NA	NA	NA	POC1A	42742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	52299133	52299501	52299437	Y	NA	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	GLYCTK	19604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	53203443	53203654	53203536	Y	PBRM1,GLT8D1,DCP1A,PRKCD	RFT1,PRKCD	NA	NA	NA	NA	PRKCD	15418	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr3	62780450	62780695	62780574	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	78359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	64033481	64033828	64033688	Y	NA	PSMD6	PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	25823	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	64147375	64147623	64147507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	139717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	64200446	64200649	64200513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	192788	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	64991801	64992000	64991901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	984143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	1005491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	65690412	65690419	65690417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	332090	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	66467141	66467203	66467172	Y	LRIG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	82484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	69376031	69376377	69376298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4B	213357	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	69698353	69698679	69698548	Y	NA	NA	MITF	IMR90	Hi-C	24141950	MITF	87907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	69797197	69797346	69797210	Y	NA	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	10611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	71149356	71149810	71149695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	481330	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	72397214	72397486	72397325	Y	RYBP	NA	SHQ1,RYBP,GXYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	96583	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	72742209	72742242	72742224	Y	NA	NA	LOC201617,PROK2,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	SHQ1	166823	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	63133	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	89163442	89163800	89163560	Y	NA	EPHA3	NA	NA	NA	NA	EPHA3	8768	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr3	98483541	98483706	98483644	Y	ST3GAL6	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	34461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	98497288	98497481	98497360	Y	ST3GAL6	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	48208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	55645	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	56078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	60181	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	99254161	99254407	99254283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	100912	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr3	101620912	101621401	101621096	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	76077	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	105838688	105838919	105838809	Y	NA	NA	CBLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBLB	252292	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	112069423	112069692	112069474	Y	SLC9A10	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	20229	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	112076380	112076550	112076391	Y	NA	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	27186	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	112830048	112830146	112830118	Y	NA	NA	BOC,WDR52	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf17	93340	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	112960908	112961353	112961141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf17	224200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	114229118	114229529	114229296	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	455658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	114881783	114882005	114881839	Y	GAP43	ZBTB20	ZBTB20	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB20	17665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr3	114884211	114884392	114884279	Y	ZBTB20	ZBTB20	ZBTB20	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB20	20093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	638640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	116060787	116061142	116061019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	682403	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	116061509	116061660	116061570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	681885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	116697369	116697471	116697420	Y	NA	PTMAP8	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	46074	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	117626867	117627207	117627037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	86888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	118710773	118710952	118710876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF11	151963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	121798974	121799563	121799190	Y	EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	242528	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	126690804	126691208	126691031	Y	ZXDC,CHST13	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	269741	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.63859823806762
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	127494264	127494411	127494370	Y	NA	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	45640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	128952340	128952748	128952739	Y	NA	NA	ISY1-RAB43,CNBP,CCDC48,GP9,KIAA1257,COPG1,C3orf37	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	51575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	131961835	131962144	131961940	Y	UBA5	RPL7P16	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	726	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	136521386	136521500	136521443	Y	NA	NA	NCK1	IMR90	Hi-C	24141950	STAG1	52166	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	136563637	136563997	136563817	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	14899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	137844377	137844651	137844514	Y	NA	DZIP1L,DBR1	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	11717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	143162621	143163181	143162827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST2	326448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	143693787	143694146	143693885	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	5147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	145992616	145992968	145992776	Y	NA	PLSCR4	PLSCR4	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	25650	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149057749	149057981	149057865	Y	NA	TM4SF18,TM4SF1	NA	NA	NA	NA	TM4SF18	7548	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	149225895	149226130	149226044	Y	RNF13	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	15448	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149271786	149271997	149271800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	61339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149297469	149297617	149297606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	87022	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149333585	149333911	149333859	Y	TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	118590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	149933925	149934322	149934006	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFN2	167350	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	151589492	151589804	151589672	Y	NA	SUCNR1	NA	NA	NA	NA	SUCNR1	61	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	151593609	151593922	151593765	Y	NA	SUCNR1	NA	NA	NA	NA	SUCNR1	4178	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	151923088	151923367	151923343	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	36250	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	153002176	153002347	153002282	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	124147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	153003780	153003941	153003880	Y	NA	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	125751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	153007263	153007499	153007331	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	129234	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	155316441	155316741	155316588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf33	205399	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886	NA	NA	NA	NA	LINC00886	5832	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	158431050	158431280	158431158	Y	NA	LXN,MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	16707	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	575789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	572545	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	167990404	167990484	167990444	Y	NA	EGFEM1P	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	25094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	170420897	170421107	170421029	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	36047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	170469010	170469069	170469037	Y	CLDN11,CLDN11,EIF5A2	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11856	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr3	170527099	170527304	170527203	Y	EIF5A2	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	170529231	170529401	170529316	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	56871	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	170841724	170842009	170841889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	217242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	170979718	170979982	170979850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	196215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	171279805	171280182	171279912	Y	PLD1,FNDC3B	NA	SLC2A2,TNIK,EIF5A2,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	TNIK	103608	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	172366671	172366874	172366806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	60134	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	173176022	173176131	173176077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	63948	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	173457450	173457753	173457673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	345376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	174493498	174493729	174493615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAALADL2	339135	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	178532692	178532946	178532777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	255121	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	178755149	178755598	178755383	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	32469	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	179244857	179244994	179244926	Y	NA	ACTL6A	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	ACTL6A	33674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	183251473	183251828	183251763	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	99528	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	183255011	183255903	183255251	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	95453	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	183271974	183272463	183272322	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	78893	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	89948	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr3	186606472	186606663	186606569	Y	ST6GAL1,RTP4	RPS20P14,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	RPS20P14	9324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	186784569	186784773	186784671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	111923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	187458720	187459019	187458856	Y	LPP,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2496	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	187883507	187883633	187883573	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	13662	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	454663	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99880	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	193989061	193989396	193989144	Y	NA	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	194875742	194876159	194875826	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	113737	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	194924510	194924749	194924615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	65147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2,APOD	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	195627582	195627903	195627662	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	179157	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr3	195628817	195629072	195628853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	177988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	195633702	195634304	195633876	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	172756	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	196437709	196437842	196437776	Y	NA	CEP19,PAK2	NA	NA	NA	NA	CEP19	545	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	196758283	196758681	196758467	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	3596	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	196761683	196762044	196761813	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	MFI2-AS1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	MFI2	6996	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	197056302	197056596	197056442	Y	KIAA0226,DLG1	DLG1	MFI2-AS1,MFI2,DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	32131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	1339085	1339471	1339276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	2143576	2143687	2143622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT8L	84337	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	3357519	3357800	3357660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	5545973	5546345	5546227	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	162930	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	5640113	5640289	5640201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	68986	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	6912537	6913143	6912820	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	3568	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	7651364	7651970	7651802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	287683	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	7830043	7830393	7830208	Y	SH3TC1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	109260	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	7969878	7969938	7969908	Y	SH3TC1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	30225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	10182011	10182277	10182105	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	65438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	10308538	10308874	10308706	Y	NA	NA	WDR1	K562	ChIA-PET	22265404	WDR1	191965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr4	11603431	11603452	11603441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	174042	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	13193944	13194185	13194064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	138853	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	13981901	13982273	13982087	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,BOD1L	IMR90	Hi-C	24141950	NKX3-2	437227	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	17495942	17496188	17496050	Y	MED28,LAP3	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	15669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	17581888	17582305	17582055	Y	LAP3,MED28	LAP3,MED28	NA	NA	NA	NA	LAP3	5073	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr4	23335645	23335866	23335720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	567846	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	12848	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr4	25536997	25537326	25537166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-302F12.1	141146	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr4	25861466	25861639	25861549	Y	RBPJ,ANAPC4,SEL1L3	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	1743	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	26887004	26887397	26887051	Y	STIM2	STIM2	NA	NA	NA	NA	STIM2	29704	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	28602494	28602613	28602520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STIM2	1745194	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STIM2	1764346	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	37477962	37478211	37478180	Y	C4orf19	C4orf19	NA	NA	NA	NA	C4orf19	24399	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	39354929	39355678	39355646	Y	NA	RFC1	WDR19	IMR90	Hi-C	24141950	RFC1	10317	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	39392246	39392603	39392519	Y	NA	RFC1	NA	NA	NA	NA	RFC1	26251	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr4	39541890	39542238	39542037	Y	NA	UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH	13959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	39813102	39813401	39813252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2K	115438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	40181948	40182292	40182189	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	125502	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	42073690	42073968	42073740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	83201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	42615195	42615457	42615407	Y	NA	ATP8A1	NA	NA	NA	NA	ATP8A1	41665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	53862934	53863152	53863043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	136477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	53985720	53986039	53985931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	244203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	55650358	55650789	55650482	Y	NA	NA	KIT	IMR90	Hi-C	24141950	KIT	128273	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	56178022	56178286	56178222	Y	TMEM165,SRD5A3	SRD5A3	KDR	IMR90	Hi-C	24141950	SRD5A3	31990	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	57940962	57941225	57941094	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	33326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	57985605	57985849	57985767	Y	NA	IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	11054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	66533536	66533932	66533732	Y	EPHA5	EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	74591640	74592145	74591915	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	12078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	FAM47E	621	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	321970	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	194168	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	81048415	81048773	81048660	Y	ANTXR2,PRDM8	ANTXR2	PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	3807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	82531268	82531394	82531331	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	397050	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	84138724	84139183	84138985	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8	NA	PLAC8,COPS4,COQ2	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	64884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	SPARCL1	42129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	88899947	88900287	88900059	Y	NA	SPP1,RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	SPP1	5128	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	90174156	90174307	90174302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	52854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	90211830	90212216	90212109	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	14945	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	90220460	90220760	90220686	Y	NA	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	6401	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	90226723	90227111	90227016	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	50	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	90391330	90391567	90391434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	164169	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	92218724	92218762	92218742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	1004788	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	93226746	93226922	93226838	Y	GRID2	GRID2	NA	NA	NA	NA	GRID2	3196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	93938951	93939057	93939003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	715401	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	101014771	101014911	101014841	Y	DNAJB14	NA	PPP3CA	IMR90	Hi-C	24141950	DDIT4L	95028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	101269712	101269900	101269796	Y	LAMTOR3	NA	NA	NA	NA	NA	DDIT4L	159773	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	102894116	102894225	102894174	Y	BANK1,BANK1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	456190	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr4	103937289	103937350	103937320	Y	NA	SLC9B1	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	1546	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	104228091	104228235	104228147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	110525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	109452742	109452987	109452865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34-AS1	86629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	111553099	111553258	111553149	Y	PITX2,PITX2	PITX2	NA	NA	NA	NA	PITX2	8021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	113205194	113205406	113205300	Y	NA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	135	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	113797634	113797869	113797752	Y	NEUROG2,ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	60369	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	113956940	113957168	113957054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	219675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	114104327	114104616	114104364	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	234863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	114312053	114312195	114312124	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27284	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	120130181	120130604	120130427	Y	NA	USP53	NA	NA	NA	NA	USP53	1138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	120205306	120205694	120205553	Y	NA	C4orf3	NA	NA	NA	NA	C4orf3	17906	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	122868336	122868638	122868444	Y	TRPC3	NA	NA	NA	NA	NA	BBS7	78684	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	124373851	124374047	124373905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	57901	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	124398959	124399392	124399124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	83009	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	124416701	124416931	124416823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	100751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	126757698	126757982	126757964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	1125811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	67742	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	100297	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	181709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	134077378	134077602	134077486	Y	NA	RP11-9G1.3,PCDH10	NA	NA	NA	NA	PCDH10	8908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	134164621	134164860	134164692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	96151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	139747631	139747907	139747769	Y	NA	NA	LOC641365	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	187036	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	140727942	140728268	140728103	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	143020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	580511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	143337797	143338156	143337961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	428429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	147379746	147379894	147379845	Y	LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	SLC10A7	61229	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	148639177	148639323	148639282	Y	ARHGAP10	PRMT10,ARHGAP10	ARHGAP10	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP10	11891	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	148754528	148754793	148754631	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	103314	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	151314417	151314500	151314459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	316991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	102053	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160A1	82203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	141910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	154004659	154004831	154004688	Y	NA	NA	FHDC1,ARFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM2	66663	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	39810	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	157692679	157692824	157692748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	197722	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr4	158941982	158942153	158942075	Y	TMEM144	NA	FAM198B,GRIA2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM198B	150317	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	159728927	159729240	159728972	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	40637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	159741404	159741764	159741424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	53114	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	170547481	170547627	170547562	Y	CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	15697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr4	170934636	170934767	170934702	Y	NA	MFAP3L	NA	NA	NA	NA	MFAP3L	17415	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	175501777	175502117	175501960	Y	HPGD	NA	NA	NA	NA	NA	HPGD	59472	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	184423820	184424211	184423984	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	ING2	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	140467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	184751768	184752101	184751917	Y	NA	NA	ENPP6,STOX2,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	173348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	185189191	185189340	185189323	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	204394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	185250931	185251612	185251274	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	142122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr4	185671621	185671780	185671770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL1	74192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	185744961	185745284	185745261	Y	NA	ACSL1	NA	NA	NA	NA	ACSL1	688	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr4	186455582	186456046	186455940	Y	NA	PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	186628790	186629146	186629018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	174024	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr4	187834148	187834163	187834155	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	188272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-219G10.1	239491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr4	189329642	189330099	189329860	Y	NA	LINC01060	TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01060	9752	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	190691	190901	190821	Y	SDHA,LRRC14B	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	25429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.95789735710143
chr5	1103805	1104368	1103973	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	5782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.78518702907137
chr5	8401222	8401229	8401225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	534072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	8843874	8844185	8844159	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA5A	700002	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	6.7430843861728
chr5	9345635	9345646	9345641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	198541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	FBXL7	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL7	46389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	16819706	16820004	16819855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	80746	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	16821332	16821498	16821415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	79252	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	16855522	16855861	16855692	Y	NA	CTB-55B8.1	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	44889	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	17118695	17119132	17119047	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO10	184323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	17184758	17185051	17184904	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	158674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	17356141	17356443	17356257	Y	BASP1	RN7SKP133,FTH1P10	BASP1,LOC401177	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P10	3408	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	32349231	32349269	32349250	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	38116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr5	34655418	34655812	34655539	Y	NA	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	1076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	96929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr5	37838959	37839206	37839080	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	1171	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	42858219	42858363	42858303	Y	NIM1	SEPP1	NA	NA	NA	NA	SEPP1	27131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	44943814	44943963	44943889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	136787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	52656733	52657108	52656801	Y	FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	117131	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	286546	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	93262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	55654713	55655022	55654890	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	56790461	56790772	56790742	Y	NA	ACTBL2	ACTBL2,PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	13825	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	456238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	542332	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	546324	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	58508843	58508938	58508881	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	632795	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	59070253	59070532	59070393	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	711008	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	59171284	59171310	59171298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	610230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	59173236	59173442	59173374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	608098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	59836852	59837180	59836950	Y	ELOVL7	PDE4D	NA	NA	NA	NA	PDE4D	20905	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	64821420	64821488	64821458	Y	NA	CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	CENPK	35510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4	255574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	66597093	66597537	66597250	Y	NA	NA	PIK3R1	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4	706917	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	67232108	67232276	67232192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	277272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	5.27719647613523
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	71790341	71790453	71790397	Y	MAP1B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	175868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	134532	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	74974099	74974276	74974194	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	37037	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77797282	77797316	77797309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	142943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77802337	77802767	77802745	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	147998	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	77809306	77809707	77809506	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	154967	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77815161	77815372	77815267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	160822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77821454	77822246	77822105	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	167115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77883814	77884068	77883938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	179776	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	77888034	77888302	77888035	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	175542	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr5	77890894	77891278	77891114	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	172566	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	78270986	78271091	78271032	Y	NA	ARSB	NA	NA	NA	NA	ARSB	8819	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	78993167	78993488	78993350	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	87224	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	80927026	80927304	80927299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	118312	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	397572	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	398492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	86417249	86417398	86417310	Y	CCNH,CCNH	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	144307	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	86417910	86418259	86418047	Y	NA	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	143446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	240753	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	88159446	88159658	88159552	Y	NA	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	38264	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26466	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	88171456	88171902	88171752	Y	MEF2C,MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	88219671	88220042	88220001	Y	NA	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	21749	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	90662566	90662573	90662570	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	14603	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	90765478	90765836	90765795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	88302	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	105733568	105733839	105733591	Y	NA	NA	EFNA5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-6N13.1	1006897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	106725486	106725757	106725607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	278839	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	106901710	106902084	106901897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	102512	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	106907307	106907511	106907485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97085	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	108022286	108022631	108022483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	58892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	108791627	108791782	108791705	Y	NA	PJA2	PJA2	IMR90	Hi-C	24141950	PJA2	47932	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	110590382	110590645	110590535	Y	WDR36,CAMK4	CAMK4	NA	NA	NA	NA	CAMK4	33031	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	110846985	110847356	110847238	Y	WDR36,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	112395053	112395446	112395196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	84654	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	112425460	112425614	112425558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	115061	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,CTB-118N6.2	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	123142909	123143354	123143175	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	297116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	123149626	123149860	123149667	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	303833	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	123774307	123774708	123774529	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	307792	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	94961	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	ZNF608	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	2512	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	127611074	127611113	127611094	Y	FBN2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	193616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	130693580	130694145	130693755	Y	FNIP1,CDC42SE2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	114394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	131835833	131835962	131835893	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF1	11343	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	132368718	132369095	132368932	Y	AFF4,ZCCHC10	AC010240.3,ZCCHC10,HSPA4	ZCCHC10,HSPA4,AFF4	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZCCHC10	8422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	93721	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	135538532	135538688	135538610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	71998	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	137826508	137826985	137826545	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	27329	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	139050998	139051193	139051098	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	26114	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	139208183	139208517	139208350	Y	NA	PSD2	NA	NA	NA	NA	PSD2	34777	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	139568486	139568801	139568644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	83124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	139570156	139570435	139570301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	84794	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	34929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	39933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	140894023	140894210	140894163	Y	NA	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	40443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	141209314	141209613	141209459	Y	NA	PCDH1	PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	47198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	141262176	141262446	141262287	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	PCDH1,KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	5365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr5	141443513	141443887	141443583	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	42183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	141951806	141951968	141951887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	195981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	142960828	142960965	142960872	Y	NR3C1,NR3C1	NA	HMHB1,NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	147751	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	145455339	145455700	145455520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	104523	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	146268013	146268084	146268061	Y	STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-255N20.1	344338	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	146751772	146751865	146751838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	135754	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	146952297	146952481	146952389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	64678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	148839357	148839440	148839397	Y	CSNK1A1	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	89567	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	153743049	153743076	153743063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	80334	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	123600	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	157030326	157030804	157030600	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	NA	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	THG1L	125401	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	157305063	157305235	157305149	Y	NA	CLINT1	CLINT1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	20880	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	158632432	158632664	158632544	Y	NA	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	2265	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	159886073	159886498	159886331	Y	SLU7	SLU7,PTTG1,MIR146A	MIR3142	IMR90	Hi-C	24141950	MIR146A	6777	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	159894087	159894191	159894139	Y	NA	SLU7,PTTG1,MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	159896720	159897088	159896809	Y	NA	PTTG1,MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	3445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr5	159898090	159898629	159898283	Y	NA	MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	4815	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	159904569	159904939	159904751	Y	NA	MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	11294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr5	159932805	159932943	159932874	Y	NA	MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	39530	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	159933720	159933957	159933888	Y	PWWP2A,SLU7	MIR146A	NA	NA	NA	NA	MIR146A	40445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	159951614	159951766	159951649	Y	FABP6	NA	NA	NA	NA	NA	MIR146A	58339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr5	160129945	160130305	160130008	Y	SLU7	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10B	146916	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	163787570	163787906	163787815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	859450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	168221385	168221766	168221495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	180068	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	190290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	169918518	169918694	169918619	Y	LCP2,KCNMB1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP1	140027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	171606484	171606964	171606720	Y	UBTD2,STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	6426	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	172203413	172203849	172203459	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	7215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	173391394	173391777	173391587	Y	CPEB4	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	78111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	CLK4	NA	NA	NA	NA	CLK4	21196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	178255974	178256130	178256077	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	28824	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr5	179513863	179514025	179513944	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	16745	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM41	13382	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM41	12696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	393896	394326	394097	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	IRF4	NA	NA	NA	NA	IRF4	4157	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF2	255763	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	2862869	2863678	2863344	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	22629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	2952080	2952258	2952142	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB6,NQO2	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	17832	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4,TUBB2B	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB2B	18098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	126135	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	5206171	5206360	5206265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	52812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	7673327	7673604	7673437	Y	NA	NA	MUTED-TXNDC5,BMP6	IMR90	Hi-C	24141950	SNRNP48	84895	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	11459328	11459680	11459376	Y	NA	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	76258	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	11744984	11745467	11745280	Y	TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	209046	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	13303878	13304185	13304075	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	22630	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	13455271	13455432	13455317	Y	NA	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30462	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	13597663	13598060	13597862	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	15499	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	14640701	14640843	14640773	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	524829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	15066743	15067555	15067031	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	176972	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	66803	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	15555860	15556076	15555941	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	105213	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	15614590	15614742	15614649	Y	JARID2,DTNBP1	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	46547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	16495109	16495178	16495163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	258298	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	16690098	16690263	16690180	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	69459	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	45988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	17910535	17910706	17910642	Y	RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	75148	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	450632	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	24929581	24929797	24929724	Y	NA	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	GMNN	156422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.66471977509391
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr6	26219063	26219301	26219164	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AE	3898	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	26233560	26233958	26233761	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	344	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	27637197	27637397	27637297	Y	OR2B6,OR2B2	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136312	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	27740489	27740807	27740621	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	32902	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZSCAN12P1,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12P1	15544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	28188130	28188520	28188276	Y	ZNF193	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	36491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	141534	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM27	84348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	30019374	30019509	30019439	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	5167	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	30736850	30737361	30737156	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	26519	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	30748515	30748873	30748611	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM,MRPS18B,PPP1R10,DDR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	38184	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	HLA-DRA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRA	22124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	32952668	32952702	32952685	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA	NA	NA	NA	NA	HLA-DMA	17797	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	32982632	32982839	32982737	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DOA	BRD2,HLA-DMA	NA	NA	NA	NA	HLA-DMA	47761	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	32996316	32996705	32996419	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,HLA-DOA	HLA-DPB1,HLA-DPA1	HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1	IMR90	Hi-C	24141950	HLA-DPB1	44998	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	33158336	33158731	33158575	Y	NA	COL11A2,SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	COL11A2	60	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD2	37463	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	33872168	33872571	33872419	Y	PHF1,ZBTB9,LEMD2	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	117255	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	35017720	35018080	35017831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	162678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	86924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr6	36326450	36326703	36326560	Y	CPNE5	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	81841	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	36660058	36660307	36660143	Y	FGD2,PXT1,STK38,SRSF3	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	17753	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE5	67821	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	39393880	39394120	39394000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	198654	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	39787581	39787781	39787659	Y	NA	DAAM2	NA	NA	NA	NA	DAAM2	29439	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	41350827	41350931	41350885	Y	NA	NA	MDFI,FOXP4,TFEB,USP49	IMR90,H1ESC,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	FOXP4	161233	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	41512989	41513289	41513139	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	FOXP4	825	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	43757757	43757886	43757846	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	21836	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	43990134	43990470	43990221	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	23817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	42884	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	45152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	45629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,TCTE1,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	44609159	44609410	44609285	Y	NFKBIE	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	255897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	45294493	45294953	45294580	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	5574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	47043667	47044082	47043892	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90	Hi-C	24141950	GPR116	122987	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	48005638	48005954	48005856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	562113	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	51738790	51738977	51738878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM3	408702	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	52505026	52505217	52505106	Y	NA	TMEM14A	EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM14A	28690	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	64088639	64088972	64088831	Y	NA	NA	EYS	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A1	140694	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	LINC00472	NA	NA	NA	NA	LINC00472	24348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	72188537	72188902	72188719	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	60065	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	73329727	73330142	73329822	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	81348599	81348680	81348638	Y	NA	NA	BCKDHB	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	534235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	85087981	85088261	85088229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	152628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	89470471	89470676	89470540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	200672	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	91004830	91005121	91005041	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	91060377	91060660	91060482	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	55750	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	99293549	99293815	99293794	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	12969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	99901572	99901766	99901669	Y	NA	RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	30365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	101965513	101965732	101965659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	638265	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	106008502	106008841	106008683	Y	NA	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	159543	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	111739300	111739614	111739444	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	63100	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	6660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	112110273	112110463	112110418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	82192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	112125712	112126337	112125987	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	66318	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	112364338	112364486	112364397	Y	TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	TUBE1	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	42246	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	112617826	112618166	112618018	Y	NA	LAMA4	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA4	43685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	112824431	112824764	112824616	Y	NA	NA	FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	LAMA4	250290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	113351587	113351965	113351776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA4	777446	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	170525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	114167209	114167452	114167327	Y	MARCKS	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	9089	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	119131601	119131904	119131835	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	81480	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	125523153	125523251	125523202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	84958	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	128830157	128830356	128830243	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	9514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	128921613	128921847	128921739	Y	NA	NA	PTPRK	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPRK	81743	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	129480057	129480411	129480316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	548959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	130001069	130001170	130001133	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	28200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	132057565	132057807	132057687	Y	NA	RP5-988G15.1	NA	NA	NA	NA	RP5-988G15.1	42645	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	132811730	132811823	132811772	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	20514	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	132812514	132812803	132812689	Y	TAAR5,C6orf192,TAAR6	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	19534	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	132832416	132832580	132832524	Y	VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	79	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.75906549204508
chr6	132972348	132972541	132972445	Y	NA	NA	STX7,TAAR6,TAAR3,VNN1,VNN3,C6orf192,TAAR9	IMR90	Hi-C	24141950	STX7	140011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	133057339	133057671	133057545	Y	STX7,VNN1,VNN2,VNN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS12	75909	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	133133336	133133580	133133458	Y	NA	SNORD101	NA	NA	NA	NA	RPS12	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	133839183	133839299	133839241	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	432009	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	134609640	134610343	134609803	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	26907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	134622486	134622615	134622584	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	14635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	134743944	134744382	134744175	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	106694	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	134838672	134838766	134838701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-557H15.4	140208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	134838896	134839303	134839202	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-557H15.4	139671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	134961963	134962506	134962356	Y	SGK1,SGK1,SGK1	RP11-557H15.4	LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-557H15.4	16468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	135804002	135804049	135804028	Y	NA	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	LINC00271	12440	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	136372344	136372809	136372483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	201510	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	136788990	136789214	136789102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	80743	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	138184436	138184726	138184672	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	1625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	138890859	138891324	138891176	Y	PBOV1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	168191	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	139852407	139852567	139852460	Y	HECA	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	158650	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	139909356	139909574	139909434	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	215599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	5.13060768513148
chr6	140383051	140383491	140383322	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	689294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	140762502	140762813	140762587	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	1068745	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	141804737	141805118	141804969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	661249	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	143192899	143193375	143193200	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	70963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	145136843	145137199	145137021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	532006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	146611524	146611827	146611649	Y	RAB32,FBXO30	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	251002	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	146866760	146867250	146866919	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	3931	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	147234581	147234754	147234661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	147480962	147481272	147481115	Y	NA	STXBP5,STXBP5-AS1	NA	NA	NA	NA	STXBP5	42289	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	147487699	147487864	147487782	Y	STXBP5	STXBP5,STXBP5-AS1	NA	NA	NA	NA	STXBP5	35697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	148358652	148358995	148358836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	148776437	148776705	148776588	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	184997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	148830845	148831563	148831298	Y	UST	NA	NA	NA	NA	NA	UST	234901	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	149380711	149381067	149380832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	156710	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	150963010	150963101	150963056	Y	PLEKHG1	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	44011	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	151815811	151815987	151815867	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	44389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	152012429	152012574	152012475	Y	ZBTB2,C6orf97,ESR1	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	36603	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	152583976	152584217	152584151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	372719	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	155506879	155507250	155506955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	68608	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	155509471	155509833	155509659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	66025	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	155510213	155510600	155510317	Y	SCAF8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	65258	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	155739222	155739872	155739692	Y	CLDN20	NOX3	NA	NA	NA	NA	NOX3	35165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	155770565	155770924	155770748	Y	NA	NOX3	NA	NA	NA	NA	NOX3	4113	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	155850166	155850642	155850364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOX3	75129	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	157421397	157421571	157421514	Y	ARID1B	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	321062	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	157695432	157695688	157695582	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	46945	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	158182288	158182636	158182583	Y	SNX9	NA	SNX9,ZDHHC14,TMEM242,SYNJ2,SERAC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	59660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	158640222	158640658	158640460	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	52838	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	160402732	160403272	160403091	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	14601	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	48290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	163826910	163827186	163827117	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	5846	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr6	165295473	165295491	165295483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	1102600	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr6	165596464	165596827	165596646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	801264	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	22766	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	167047183	167047629	167047332	Y	SFT2D1,RNASET2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	270310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	82451	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	184582	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	AC147651.4	NA	NA	NA	NA	AC147651.4	11820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	655576	655910	655797	Y	NA	AC147651.4	NA	NA	NA	NA	AC147651.4	14754	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	964406	964697	964471	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	28346	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr7	965289	965600	965408	Y	ZFAND2A,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	27443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	1965570	1966023	1965918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	185643	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	2063741	2064015	2063879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	206863	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	2145561	2145831	2145692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	125047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	2996430	2996653	2996492	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	114472	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	4660172	4660397	4660258	Y	NA	FOXK1	SDK1,FOXK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	20991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5578052	5578271	5578166	Y	NA	FBXL18,ACTB	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	ACTB	23144	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5598432	5598800	5598734	Y	NA	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	2615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	13085757	13085829	13085793	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	361276	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	17314276	17314419	17314335	Y	AHR	AHR,AC003075.4	NA	NA	NA	NA	AHR	21827	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	17729678	17729968	17729803	Y	AHR	NA	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	248156	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	18575593	18575869	18575740	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	451021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	18678711	18679112	18678888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	476183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	19017733	19017917	19017790	Y	TWIST1	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	137378	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	19119779	19120171	19119934	Y	NA	TWIST1	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST1	35124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	128935	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	20447290	20447655	20447472	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	78965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	20582388	20582432	20582424	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB5	70398	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	22122992	22123068	22123014	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	139290	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	22687053	22687419	22687223	Y	IL6	STEAP1B	LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP1B	16509	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	23289024	23289054	23289046	Y	NA	GPNMB	NA	NA	NA	NA	GPNMB	15438	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr7	24818395	24818855	24818677	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	26523285	26523306	26523295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	87072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	27176942	27177056	27176971	Y	HOXA3,HOXA5	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA5	4231	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	28180762	28180941	28180859	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	37000	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	28191527	28192056	28191751	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	25885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	28205904	28206253	28206092	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	11688	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	28549355	28549638	28549419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	212415	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	29294942	29295238	29295004	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	61875	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	30203047	30203422	30203138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	118501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	32026855	32027150	32027002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	309791	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr7	32114937	32115108	32115024	Y	PDE1C,PDE1C,PDE1C	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	221833	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	33598181	33598239	33598235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	431325	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	35768741	35769300	35769082	Y	HERPUD2	HERPUD2	SEPT7	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD2	35560	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	39454182	39454306	39454268	Y	POU6F2	NA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	149669	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	40584238	40584551	40584395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	40585377	40585721	40585560	Y	NA	AC004988.1	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	850	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	40591236	40591497	40591392	Y	NA	AC004988.1	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	6709	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	40624783	40624915	40624850	Y	NA	AC004988.1	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	40256	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	172432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	41800026	41800177	41800090	Y	INHBA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	59320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	41925856	41926073	41926056	Y	INHBA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	185150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	43626451	43626626	43626528	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	6094	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	43835897	43835899	43835898	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	39618	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	44127636	44127736	44127679	Y	YKT6,AEBP1	DBNL,PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2	PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B	IMR90	Hi-C	24141950	POLM	7497	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	44775082	44775384	44775244	Y	OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2	ZMIZ2	DDX56,TMED4,OGDH,PPIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ2	10796	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	45442455	45442729	45442646	Y	MYO1G	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	169010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	45616146	45616461	45616432	Y	NA	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	4407	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	46972513	46972753	46972628	Y	NA	NA	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC011294.3	175064	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	47343610	47343904	47343861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	276252	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	47475545	47475747	47475668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	144409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	48031393	48031616	48031481	Y	HUS1	PKD1L1,HUS1,C7orf57	HUS1	K562	ChIA-PET	22265404	HUS1	14215	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	48127053	48127182	48127123	Y	HUS1,UPP1,UPP1	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	50937136	50937349	50937243	Y	NA	NA	COBL,DDC,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	77977	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	55627150	55627445	55627300	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	11236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	65762762	65763060	65762890	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	94576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.81130856609767
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	66897123	66897210	66897167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	131229	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	76874732	76875015	76874923	Y	NA	FGL2	NA	NA	NA	NA	FGL2	47589	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	79050066	79050245	79050154	Y	MAGI2	MAGI2-AS3,MAGI2	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	29953	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	79844591	79844960	79844776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	83320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	80128570	80128822	80128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD36	131679	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	84244540	84244678	84244625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	124500	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	87453552	87453801	87453676	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	49730	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	89824940	89825230	89825139	Y	NA	STEAP1,C7orf63	NA	NA	NA	NA	STEAP1	43251	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	92217809	92218139	92217980	Y	NA	FAM133B	NA	NA	NA	NA	FAM133B	101	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	92262528	92262734	92262631	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	92263416	92263696	92263624	Y	SAMD9,CDK6	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	45708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	162543	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	95546532	95546890	95546577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDK4	322729	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	96592754	96592990	96592764	Y	FLJ42280,DLX6,DLX5	DLX6	NA	NA	NA	NA	DLX6	39870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	96646199	96646417	96646378	Y	DLX6,DLX5	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX5	5992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	96748066	96748124	96748095	Y	NA	ACN9	NA	NA	NA	NA	ACN9	4164	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	97763037	97763356	97763224	Y	BRI3,LMTK2	LMTK2	NA	NA	NA	NA	LMTK2	28840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	98047040	98047207	98047124	Y	NA	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1	K562	ChIA-PET	22265404	BAIAP2L1	18660	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	99942530	99942666	99942614	Y	OR2AE1,ZCWPW1,MEPCE,PILRA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	4999	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	99965993	99966135	99966041	Y	C7orf59,C7orf43,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	28462	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	104395583	104395928	104395756	Y	NA	LHFPL3-AS1	NA	NA	NA	NA	LHFPL3-AS1	46626	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	104460148	104460372	104460286	Y	NA	LHFPL3-AS1	NA	NA	NA	NA	LHFPL3-AS1	17594	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.3454206560601
chr7	104584670	104585063	104584938	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	66428	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43127	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	105416484	105416867	105416678	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	41071	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	106206962	106207238	106207108	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC004917.1	92104	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	402356	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	110326819	110326998	110326909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	402064	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	110723657	110723799	110723727	Y	LRRN3	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	5263	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	79348	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	127806	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	145495	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	227672	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	111641194	111641556	111641398	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	202910	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	RN7SKP187	NA	NA	NA	NA	RN7SKP187	45217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	112383831	112384204	112384019	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	44443	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	113688055	113688258	113688160	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	36124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES,CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	37825	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC073130.3	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073130.3	29282	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	121120093	121120403	121120217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	85675	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	121439115	121439246	121439188	Y	PTPRZ1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRZ1	71897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	121783025	121783385	121783205	Y	PTPRZ1,AASS	AASS	NA	NA	NA	NA	AASS	691	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	123903491	123903761	123903674	Y	NA	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	GPR37	499920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	127775885	127775901	127775893	Y	NA	NA	SND1,MIR129-1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	206061	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	128094514	128094949	128094639	Y	LEP,C7orf68	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	NA	NA	NA	NA	HILPDA	611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	4.54425252111645
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	129609674	129609888	129609791	Y	NA	UBE2H	AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2H	18885	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr7	130697034	130697567	130697379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95288	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130720133	130720826	130720768	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	72029	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	130916172	130916668	130916569	Y	NA	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	8681	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	132441115	132441141	132441128	Y	NA	NA	FLJ40288	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD3	323707	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	132660683	132660693	132660688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	104155	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B4	293105	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	134422783	134423192	134423006	Y	NA	CALD1	CALD1,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	CALD1	3811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	134798847	134799175	134799011	Y	NA	TMEM140	NA	NA	NA	NA	TMEM140	31649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	NA	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	98196	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.81130856609767
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	3879	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	137264728	137264844	137264813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	419969	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	137402741	137402885	137402822	Y	DGKI	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	281928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	137544616	137544738	137544677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	140075	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	137661285	137661695	137661644	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	23118	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	137673807	137674359	137674139	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	10454	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	137928273	137928746	137928445	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	52483	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	138035380	138035759	138035568	Y	CREB3L2,SVOPL,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.1	51509	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	108924	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	139975435	139975617	139975498	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	PARP12,LOC100134229,JHDM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC37A3	126616	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	140375225	140375407	140375313	Y	BRAF,JHDM1D	ADCK2,NDUFB2	NA	NA	NA	NA	ADCK2	4272	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	141285767	141286195	141285861	Y	TAS2R38,AGK	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	36778	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58429	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.3454206560601
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr7	150691752	150691942	150691795	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542	KCNH2,ABCB8	NA	NA	NA	NA	KCNH2	18349	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	150705271	150705459	150705364	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,KCNH2	KCNH2,ABCB8,SLC4A2,CDK5	NA	NA	NA	NA	ABCB8	18051	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	151453235	151453789	151453377	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	118338	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	66552	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28363	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr7	154742897	154743129	154742996	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49665	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr7	155383034	155383540	155383287	Y	RBM33	NA	LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM33	51605	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	479972	480137	480087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO25	125544	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	603336	603665	603448	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	82441	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	637812	637858	637835	Y	NA	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	48248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	1414853	1414992	1414933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	286952	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	1762268	1762565	1762495	Y	KBTBD11,ARHGEF10	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	7577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	2131397	2131523	2131471	Y	CLN8	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	211353	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	498785	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	1332621	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	8792975	8793244	8793001	Y	CLDN23	MFHAS1	MFHAS1,FLJ10661,SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	MFHAS1	43820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	10193189	10193473	10193425	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	283411	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	10692830	10693156	10692993	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	2238	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.05224307405259
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	11562739	11563084	11562994	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	30271	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	11690057	11690160	11690110	Y	NA	SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB	NA	NA	NA	NA	RP11-297N6.4	31980	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	11754568	11755261	11754938	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	29611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	13004776	13005088	13004835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1456	203625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	13302544	13302935	13302756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	68232	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	17465660	17466084	17465890	Y	MTUS1	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	33718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	17466233	17466439	17466333	Y	NA	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	34291	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	18836263	18836433	18836318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	332695	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	SLC18A1,ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	20058362	20058772	20058410	Y	ATP6V1B2	SLC18A1,ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	5484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	33495	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr8	20167372	20167597	20167485	Y	NA	LZTS1	ATP6V1B2,LZTS1,SLC18A1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	7898	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	22535910	22536200	22536167	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	11249	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr8	22855581	22855914	22855756	Y	EGR3,EGR3,EGR3	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	12651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	22872750	22872814	22872762	Y	NA	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-875O11.1	2034	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	23341023	23341429	23341344	Y	NA	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37	IMR90	Hi-C	24141950	ENTPD4	27815	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	24194480	24194906	24194724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-148P	261809	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr8	25096912	25097126	25097024	Y	DOCK5	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	56674	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	26436602	26437074	26436866	Y	PNMA2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	66811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28193434	28193777	28193606	Y	NA	PNOC	NA	NA	NA	NA	PNOC	20931	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	28352811	28353080	28352947	Y	HMBOX1,HMBOX1,FZD3	FBXO16,FZD3	NA	NA	NA	NA	FZD3	3082	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3	113834	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28635981	28636227	28636104	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	109532	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	INTS9	108163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	28890628	28890717	28890674	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	20735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	29204481	29204724	29204678	Y	NA	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	1461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	29260077	29260481	29260326	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75,DUSP4,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,LEPROTL1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	53892	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29347920	29348328	29348072	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	NA	C8orf75,LOC286135,MIR3148,DUSP4,MIR548O2,TMEM66	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	141735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29356550	29356734	29356564	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	NA	LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	150365	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29357586	29357867	29357737	Y	KIF13B	NA	LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	151401	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29498284	29498389	29498338	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	AC145110.1	105436	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29516615	29516871	29516762	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90	Hi-C	24141950	AC145110.1	86954	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	AC145110.1	70522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	AC145110.1	NA	NA	NA	NA	AC145110.1	8611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29630716	29630847	29630782	Y	NA	AC145110.1	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC145110.1	26891	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	29957112	29957836	29957408	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	6198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	30666266	30666462	30666364	Y	NA	PPP2CB	NA	NA	NA	NA	PPP2CB	3368	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	135724	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr8	36488969	36489000	36488983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF703	1062269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	37889292	37889604	37889448	Y	NA	EIF4EBP1	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP1	3433	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	38770998	38771507	38771224	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	14245	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	NA	NA	NA	NA	NA	SFRP1	1132479	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	41015718	41016076	41015872	Y	SFRP1	NA	SFRP1	IMR90	Hi-C	24141950	SFRP1	148940	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	41448133	41448452	41448288	Y	GOLGA7,GOLGA7,MYST3,AGPAT6	AGPAT6,RP11-360L9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	14246	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	41882456	41882591	41882524	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	24917	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	42072486	42072556	42072531	Y	NA	PLAT	AP3M2,IKBKB	IMR90	Hi-C	24141950	PLAT	9244	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	49430601	49430974	49430806	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	135451	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr8	49816123	49816479	49816309	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	15820	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	55382610	55382722	55382677	Y	SOX17	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL15	336840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	59714074	59714335	59714193	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	143671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	61825257	61825601	61825298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	235920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	62937802	62937913	62937858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	312647	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	182461	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	C8orf46	NA	NA	NA	NA	C8orf46	49580	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	67694398	67694637	67694506	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	16158	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H10.3	1071920	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	227913	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr8	81289521	81289894	81289680	Y	ZBTB10	NA	ZNF704	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB10	105960	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81394996	81395282	81395074	Y	NA	ZBTB10	ZBTB10	K562	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	572	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81615108	81615487	81615408	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	219254	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81639602	81640013	81639931	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	243748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81776862	81777324	81777099	Y	PAG1,ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	244979	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81933989	81934508	81934361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	87795	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	81962809	81963138	81963038	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	59165	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	91549182	91549268	91549225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	252592	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	91944929	91945085	91945007	Y	NECAB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM55A	106207	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	94850724	94850939	94850832	Y	GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17096	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	95219115	95219484	95219300	Y	NA	KB-1247B1.1	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	5835	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	97319675	97319761	97319753	Y	NA	MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	47732	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	97921730	97922056	97921913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	418151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	99021655	99021985	99021673	Y	NA	RPL30	NA	NA	NA	NA	RPL30	34712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	101514609	101515240	101514976	Y	YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD46	54772	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	NA	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1	53111	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	35564	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102140192	102140420	102140327	Y	YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	76001	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	104093090	104093280	104093223	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32,DCAF13	NA	NA	NA	NA	NA	BAALC	57658	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	104149565	104149597	104149584	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32	BAALC,C8orf56	NA	NA	NA	NA	BAALC	1341	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	104198945	104199161	104199050	Y	NA	BAALC,C8orf56	NA	NA	NA	NA	C8orf56	47242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	105034041	105034154	105034124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	464424	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.19883186505635
chr8	105409050	105409327	105409190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	189925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	105598029	105598284	105598149	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	NA	NA	NA	NA	LRP12	968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	105630140	105630377	105630280	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	LRP12	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP12	30888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	106779848	106780177	106780013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	290575	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	106878097	106878155	106878126	Y	NA	NA	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	192597	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	107485450	107485801	107485626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXR1	204977	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	115947625	115947931	115947832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	871968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	116068457	116069128	116068655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	750771	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	116463689	116463880	116463766	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	356019	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	116988617	116988643	116988632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	168718	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	120779948	120780281	120780115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF2	62822	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	121574734	121575043	121574888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	119092	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	121628287	121628559	121628462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	172645	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	121809679	121809816	121809747	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	13697	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	121821026	121821194	121821110	Y	SNTB1	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	2319	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	121839869	121840146	121840008	Y	NA	SNTB1	SNTB1	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	16356	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	123106451	123106468	123106460	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	454821	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	124665857	124666229	124666132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	112467	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr8	124684984	124685340	124685256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	93356	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	125279345	125279667	125279489	Y	FAM91A1,RNF139	RP11-383J24.1	FAM91A1,TMEM65,FER1L6-AS1,FER1L6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	2257	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	23044	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	125878645	125879203	125878949	Y	RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196	NA	MTSS1,NDUFB9,TATDN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1082L8.4	52721	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	126083515	126083743	126083629	Y	NA	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	NSMCE2	18178	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	130323839	130324175	130323987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	703200	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr8	130548053	130548359	130548185	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	479016	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	130584178	130584343	130584235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	443032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	131007390	131007737	131007622	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	19638	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	131245360	131245556	131245456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	208350	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	134104989	134105333	134105063	Y	ST3GAL1,TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	206932	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	134119635	134119781	134119708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	192484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	134552406	134552812	134552641	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	29371	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr8	141361313	141361457	141361385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	105221	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	143086235	143086279	143086257	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	TSNARE1	396322	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	143757526	143757895	143757616	Y	NA	PSCA,JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	3491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	145088816	145089042	145088955	Y	PLEC,GRINA,SPATC1	PLEC,GRINA,PARP10,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1	NA	NA	NA	NA	PARP10	3876	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	145558616	145559185	145558966	Y	ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	10043	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	614528	614756	614656	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	146237	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	708345	708423	708359	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240054	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	708443	708758	708711	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	749759	749963	749884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	281468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr9	751014	751390	751179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	282723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	2465114	2465154	2465134	Y	NA	NA	VLDLR,FLJ35024	IMR90	Hi-C	24141950	VLDLR	154680	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	3576230	3576494	3576362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	51507	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	4835219	4835506	4835309	Y	CDC37L1,RCL1	RCL1	NA	NA	NA	NA	RCL1	44350	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	5895206	5895407	5895334	Y	NA	MLANA	NA	NA	NA	NA	MLANA	6404	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr9	9469595	9469625	9469608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	380719	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.46588791003756
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	938934	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	12421960	12422048	12422006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYRP1	261391	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr9	13237438	13237544	13237492	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	40045	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	16526132	16526493	16526417	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	198319	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	17018101	17018829	17018153	Y	NA	NA	C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	CNTLN	114151	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr9	17520540	17520838	17520658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	56242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	20821674	20822013	20822003	Y	IFNA5,IFNA21	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	201132	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	21681581	21681928	21681849	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	118614	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	22414049	22414273	22414161	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	30567	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	27352450	27352737	27352522	Y	IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	175042	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	28539492	28539760	28539590	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	967628	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	28753682	28753926	28753804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1181818	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	28768003	28768359	28768181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1196139	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr9	29211344	29211542	29211410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1618681	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1615829	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.90565428304883
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	32443270	32443461	32443367	Y	TOPORS,DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	60652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	34332110	34332236	34332173	Y	NA	SERPINH1P1,KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	NUDT2	4606	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	34454815	34455060	34454916	Y	NA	DNAI1	NA	NA	NA	NA	DNAI1	352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	36294075	36294254	36294162	Y	OR13J1,OR2S2	GNE	RNF38,CLTA,GNE	IMR90	Hi-C	24141950	GNE	19022	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	38682685	38683007	38682923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1B1	292024	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	71922503	71922965	71922747	Y	NA	NA	FAM189A2	IMR90	Hi-C	24141950	TJP2	188294	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr9	73025378	73025559	73025525	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	1981	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.61247670104132
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.22495340208264
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	73100288	73100509	73100429	Y	KLF9	NA	SMC5,KLF9,TRPM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF9	72748	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	73178223	73178568	73178449	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	150683	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	73202028	73202554	73202277	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	174488	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr9	73219456	73219798	73219627	Y	TRPM3,KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	191916	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	490399	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	75129013	75129167	75129063	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	150850	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	75549526	75549619	75549601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-151D14.1	62501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	79018113	79018533	79018297	Y	NA	RFK	NA	NA	NA	NA	RFK	10680	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	80325325	80325445	80325383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	318929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	82226280	82226508	82226439	Y	TLE4	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	41592	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	88137059	88137474	88137228	Y	NA	NA	NTRK2	IMR90	Hi-C	24141950	AGTPBP1	217470	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	90110115	90110289	90110202	Y	CTSL1,DAPK1	RP11-40C6.2	DAPK1	K562	ChIA-PET	22265404	DAPK1	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	90196338	90197001	90196617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	58121	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NA	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	123807	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	RP11-305L7.3	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	32622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	94860272	94860642	94860609	Y	NA	SPTLC1,LINC00475	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	15024	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr9	97590305	97590486	97590422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	103322	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr9	98331045	98331356	98331197	Y	NA	NA	FANCC,LOC158435,C9orf102,SLC35D2,LINC00476	IMR90	Hi-C	24141950	PTCH1	53706	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	98823604	98823957	98823737	Y	NA	NA	PTCH1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	82332	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.19883186505635
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	100685565	100685605	100685585	Y	NA	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	2713	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	101630117	101630425	101630271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT12	62136	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	103192373	103192745	103192675	Y	C9orf30	NA	C9orf30-TMEFF1	IMR90	Hi-C	24141950	TEX10	79152	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	106995057	106995251	106995156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	140516	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABCA1	66894	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	107983498	107983520	107983511	Y	NA	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	21383	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	108052780	108053053	108052862	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	47877	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	110401220	110401740	110401394	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	106549	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	26333	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	46195	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	112858157	112858314	112858244	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	72519	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	113886558	113886563	113886560	Y	NA	NA	LPAR1,MUSK,KIAA0368	IMR90	Hi-C	24141950	LPAR1	87577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	114821548	114821936	114821739	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	113752	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	115440529	115440762	115440646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-276E15.4	69974	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	116937744	116937911	116937764	Y	ORM1,COL27A1	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	21904	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	117171817	117171955	117171874	Y	TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	93775	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	117247262	117247587	117247370	Y	TNFSF8,TNFSF15,ATP6V1G1,DFNB31	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	18143	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556735	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	745887	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr9	118789906	118790104	118789991	Y	NA	NA	LINC00474,PAPPA,ASTN2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	657477	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123346430	123346633	123346540	Y	TRAF1	CDK5RAP2	CDK5RAP2	K562	ChIA-PET	22265404	CDK5RAP2	5982	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123652531	123653088	123652891	Y	CNTRL,FBXW2,TRAF1,TRAF1,TRAF1	PSMD5,PHF19,TRAF1	PHF19	IMR90	Hi-C	24141950	PHF19	14925	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123658471	123658684	123658522	Y	TRAF1,TRAF1	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	20865	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123672151	123672562	123672479	Y	FBXW2,TRAF1,TRAF1,TRAF1	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	TRAF1	16889	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123681389	123681583	123681539	Y	NA	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	TRAF1	7868	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	123681612	123681912	123681860	Y	TRAF1,TRAF1	PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	TRAF1	7539	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STOM	231066	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	2.78518702907137
chr9	126102323	126102736	126102675	Y	NA	NA	RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STRBP	73468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	127045133	127045416	127045344	Y	NEK6,NEK6	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	27248	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	127621077	127621225	127621167	Y	NA	RPL35,ARPC5L,RNU4-82P	NA	NA	NA	NA	RPL35	1035	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	130834970	130835273	130835056	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	6485	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	41091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	40833	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	30379	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-483H20.4,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-483H20.4	28069	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	132505331	132505539	132505390	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	7787	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chr9	133565926	133566149	133566038	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	959	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	133721974	133722320	133722184	Y	NA	NA	QRFP,FIBCD1	IMR90	Hi-C	24141950	ABL1	134641	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	134511243	134511633	134511541	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	101828	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	134602820	134603314	134602971	Y	PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	10147	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	134770006	134770262	134770128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	156545	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	134882586	134882673	134882600	Y	SETX,NTNG2,MED27	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	70622	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	136008698	136009031	136008833	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	28270	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	136292897	136293168	136293034	Y	SLC2A6,RALGDS	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	REXO4	11733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	246444	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	137739401	137739789	137739783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	225479	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	138780125	138780291	138780208	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	16783	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chr9	139606234	139606418	139606254	Y	LCNL1,FUT7,CLIC3,C9orf142,ABCA2,KIAA1984	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	1212	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	6.30331801316153
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.0261215370263
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	1513605	1514177	1513885	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	3988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	3591324	3591658	3591618	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	37991	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	730844	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR143	50948	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	GPR143,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	9979967	9980360	9980271	Y	NA	WWC3	NA	NA	NA	NA	WWC3	1242	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	13077920	13078128	13078034	Y	TLR7	NA	LOC100133123,TMSB4X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMSB4X	86693	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	13665848	13666134	13665956	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	TCEANC	3091	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	13709946	13709989	13709968	Y	RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	4702	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	13906488	13906633	13906544	Y	GPM6B,GPM6B	GPM6B	NA	NA	NA	NA	GPM6B	48124	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chrX	15868286	15868660	15868596	Y	BMX	AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	2394	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chrX	17856457	17856771	17856610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCML1	102869	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	18488966	18489254	18489110	Y	NA	CDKL5	NA	NA	NA	NA	CDKL5	47263	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	19643767	19644028	19643952	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K15	112388	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	21945015	21945333	21945248	Y	NA	SMS	SMS,MBTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	11358	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	23902825	23903036	23902985	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	21021	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.879532746022539
chrX	24027801	24028121	24027962	Y	NA	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	42712	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	1149249	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chrX	29610847	29611180	29610948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	1035235	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	17.0042997564358
chrX	29681325	29681360	29681343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	965055	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	29699916	29700254	29699978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	946161	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	31519130	31519361	31519245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB3	527929	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	40005202	40005365	40005305	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	29217	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	40749971	40750359	40750172	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	14878	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	41097774	41098084	41098012	Y	USP9X,GPR82,DDX3X	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	92567	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	41125005	41125150	41125071	Y	NA	NA	DDX3X,USP9X	IMR90	Hi-C	24141950	DDX3X	65501	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	46125056	46125409	46125233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	59671	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	49139256	49139619	49139438	Y	FOXP3,PPP1R3F	CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	14950	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	53398923	53399250	53399087	Y	NA	RIBC1,SMC1A	NA	NA	NA	NA	RIBC1	48389	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	64917800	64918054	64917950	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	111543	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	67724193	67724408	67724299	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	8028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	67905691	67905742	67905716	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40183	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.732943955018782
chrX	69655002	69655313	69655257	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	7398	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.17271032803005
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX5	62688	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	106917807	106918338	106918010	Y	TSC22D3,TSC22D3	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	48070	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	114925070	114925398	114925234	Y	NA	EEF1GP5	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	9733	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	3.3715421930864
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	120720651	120720690	120720671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	958646	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	123351438	123351580	123351505	Y	SH2D1A	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	259376	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	124338810	124338926	124338869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF12L2	959154	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	124340013	124340052	124340037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF12L2	958028	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.439766373011269
chrX	129308130	129308357	129308196	Y	ELF4,ELF4	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	10269	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	129848088	129848429	129848259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	186779	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	129961561	129961881	129961697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	73327	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	1.31929911903381
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	131625337	131625543	131625484	Y	MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	3341	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	132323332	132323559	132323446	Y	HS6ST2,USP26,GPC4	RNU1-115P	NA	NA	NA	NA	RNU1-115P	47285	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	GPC3	187840	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.586355164015026
chrX	133320992	133321049	133321007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF6	184234	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	133756354	133756493	133756422	Y	NA	NA	MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542	IMR90	Hi-C	24141950	HPRT1	164171	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	133952675	133952993	133952834	Y	NA	FAM122C,FAM122B	NA	NA	NA	NA	FAM122B	23413	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	ARHGAP4	31602	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	153311757	153312308	153312067	Y	NA	IRAK1,MECP2	NA	NA	NA	NA	IRAK1	28326	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.293177582007513
chrX	153965423	153965624	153965606	Y	NA	GAB3,DKC1	CTAG2	IMR90	Hi-C	24141950	GAB3	12234	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	COLO 679	hg19	FANTOM5	0.146588791003756